基于膜显色结果判读的HCV基因分型检测芯片平台构建

来源 :郑州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:galatea
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的:丙型肝炎是一种流行较为广泛的病毒性疾病,是一个对社会及经济有重要影响的全球问题。据估计,全球有1.7亿人口,即全世界3%左右的人口感染了丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)(世界卫生组织)。HCV归属黄病毒科(Flaviviridae family)的嗜肝病毒属,与其他RNA病毒一样,HCV在复制过程中由于缺乏有效的修复机制,故易发生变异,逃避宿主免疫监视,因无有效疫苗,其感染率呈上升趋势。按其基因组序列异质性程度高低可分基因型(30%)、亚型(20%)及分离株(10%)。不同的基因型其慢性化程度及对干扰素的反应等也不尽相同。目前实验室检测HCV常用免疫学方法和PCR方法,前者检测灵敏度有一定的局限性,如血清中抗原浓度过低或抗体尚未产生(即“窗口期”)会检测不出,若想诊断出大量基因型,此方法更显得无力;PCR方法检测虽可以缩短“窗口期”,但对基因型的检测不仅操作烦琐、费时,且很难实现。本研究目的在于研制一种DNA芯片,通过杂交,尼龙膜显色方法,达到快速、经济、灵敏、准确检测HCV及其基因型的目的。 方法:本研究采取的方法是依据基因型的核酸一级结构序列设计相应的探针,然后将合成好的寡核苷酸探针用点样仪点于玻璃片表面,制成DNA芯片,通过杂交,尼龙膜显色方法进行检测HCV及其基因型。 首先,构建了7个含丙型肝炎基因型的标准质粒,包括1a、1b、2a、2b、3a、3b、6a。以这些标准质粒作为实验的材料及参照。 根据HCV 5′端非编码区(5′NCR)设计特异型探针和引物,制作DNA芯片。在实验过程中,我们对PCR条件、杂交条件以及显色条件等进行了优化。 实验组为60份HCV RNA阳性血清,对照组为20份健康人血清。获得目的片郑州大学2004届硕士学位论文段后与芯片杂交,最后通过尼龙膜上的显色信息判读基因型。同时以测序法进行双盲HCV基因分型对照检测。 结果:实验组HCV芯片检测结果均为阳性,对照组均为阴性。实验组基因分型检测结果与测序结果二者符合率为%.7%。 结论:表明用基于膜显色结果判读的DNA芯片来检测HCV基因分型具有快速、经济、高特异性和高灵敏度的特性,可以应用于HCV及其基因分型临床检测。
其他文献
目的:检测XRCC1基因Codon194、Codon399和APEX基因Codon148多态性,及APC基因Codon1339-1436区突变,探讨这些区域的单个基因变异和多个基因联合变异与散发性大肠癌发生之间的
目的:通过对男性不育症肾虚型肾精气不足型、肾阴虚衰型、肾阳不足型三型的精液五种酶的联合检测,分析相关酶水平的变化,探索诊断男性不育症的实验室检查手段,寻求更客观的男
目的:显微切割胃癌及癌前病变细胞检测染色体7q31.1区域的杂合性缺失,绘制胃癌及癌前病变7q31.1区域等位基因缺失图谱,确定其常见最小缺失区域,探索胃粘膜上皮癌变过程中不同
【目的】  1. 检测肿瘤关键转录抑制因子Pokemon及EMT(上皮间质转化)核心转录因子Snail、HPV感染标志物P16和Survivin在宫颈病变组织(宫颈炎、宫颈上皮内瘤变(CIN)、未转移宫颈
对TC18钛合金进行了简要介绍,并提供了模锻方法生产TC18钛合金锻件的显微组织和力学性能。结果表明,这种方法生产的TC18钛合金锻件能够获得良好的显微组织及优异的力学性能,
林丽荣,1978年出生,1996年中专毕业后入职厦门柯依达工贸有限公司,她用了15年的时间,一路积极进取、勤勤恳恳,从研发部门的实习实验员起步,成长到研发部门的“一把手”.rn林
1概述路灯照明系统是城市建设不可缺少的公用设施,设计自动化程度高、运行可靠、高效节电、使用维护方便并能美化市容的路灯系统,是路灯控制与管理现代化的必然要求。我所研制开
分析并行工程下协同设计的特点,提出一种事件触发的任务调度策略。为了合理地进行任务调度,在提出调度获益函数的基础上建立了协同设计的任务调度模型。运用遗传算法求解该调度
目的:为寻找有价值的日本血吸虫(Sj)疫苗候选分子和诊断抗原,该课题从模拟表位肽的筛选、基因筛选、亚克隆与表达及免疫保护性等方面进行了研究;为了加强DNA疫苗的免疫保护效
目的:表达SARS冠状病毒核壳蛋白,研究建立SARS冠状病毒感染血清学的诊断方法。 方法:构建携带SARS冠状病毒核壳抗原融合蛋白质粒,将表达载体转入大肠杆菌,原核表达His-N融合蛋