鲤是最早被人类养殖的鱼类品种,也是目前世界范围内养殖最为广泛的鱼类品种,鲤养殖成效在很大程度上影响着水产业的发展。良种是渔业生产的物质基础,扩大生产和积极推广优良品种,是提高鱼产量的有效途径,是科研成果迅速转化为生产力的有效措施。我国鲤产量的快速增长,很大程度上得益于鲤品种改良成果的应用。建鲤是淡水渔业研究中心育成的我国第一个遗传性状比较稳定的优良鲤品种,生长速度快,能自繁自育,适应性强,在全国得到广泛的推广。黄河鲤为分布于北方黄河水系的著名鲤地方品种,具有抗寒力强,饲料转化率高,易起捕等优点。黑龙江野鲤是黑龙江干流的主要经济鱼类,是黑河市得天独厚的优良养殖品种。兴国红鲤、荷包红鲤、高背荷包红鲤为均产于江西省,因体呈橘红色而得名,是经长期人工选育而培育成的形态特征显著和遗传性状稳定的养殖品种。上述几个群体群体不管是野生群体还是人工育成群体,在我国鲤遗传育种研究中均占有非常重要的地位。本试验对黄河鲤、荷包红鲤、高背荷包红鲤、兴国红鲤、建鲤和黑龙江野鲤等6个鲤群体的形态比例性状进行了主成分分析。主成分分析构建了2个主成分,其贡献率分别为51.06%、31.84%,累计贡献率为82.90%,并可将6个鲤群体划分为2个簇,荷包红鲤和高背荷包红鲤明显的与其他群体区分开来。结果表明,6个鲤群体在形态上存在一定的分化,分化主要体现在头部和体型特征上。RAPD分子标记因其操作简单快速、无种属特异性,有足够的引物可供使用,多态性检出率高等优点已被广泛应用于种质鉴定、亲缘关系分析,遗传多样性分析、遗传连锁图的构建,特定基因的标记和定位,人类基因组研究等许多领域。本试验主要是采用RAPD的方法,对建鲤、黄河鲤、黑龙江野鲤、荷包红鲤、兴国红鲤的基因组进行RAPD扩增分析。用50个随机引物对五种鲤的基因组DNA进行RAPD扩增,36个引物扩增出条带,其中有25个引物能够扩增出清晰、稳定的条带,用来分析。25个引物共扩增出348条带,平均每个引物扩增出14条带,位点总数为92个,多态位点数为49个,多态位点比例平均为53%。其中兴国红鲤、荷包红鲤、黄河鲤、建鲤、黑龙江野鲤各自的位点数及多态位点比例分别为：70,76.09%；71,77.17%；73,79.35%;69,75.00%；65,70.65%。群体间的相似性系数：黑龙江野鲤和建鲤间的遗传相似性系数最大(0.7789),荷包红鲤、兴国红鲤、黄河鲤间的遗传相似性系数次之(0.7000),黄河鲤和建鲤、黑龙江野鲤间的遗传相似性系数最小(0.6263)。使用MEGA3.1中NJ法和UPGMA法对5种不同的鲤构建的NJ系统树和UPGMA系统树,分析其亲缘关系,结果表明兴国红鲤和荷包红鲤之间的亲缘关系最近。50个引物用于扩增分析,其中S141、S142、S149分别在建鲤中扩增出680bp、625bp、120bp片段；S103、S106、S139分别在黄河鲤中扩增出1414bp、360bp、1800bp片段；S145在荷包红鲤中扩增出800bp片段；S132在黑龙江野鲤中扩增出700bp片段；S120在兴国红鲤中扩增出230bp片段。以上各片段只在某个群体中扩增出来,可能为该群体的特异标记,有待于进一步进行个体验证。通过个体进一步的验证,获得各群体的特异遗传标记,从而实现建鲤、黄河鲤、黑龙江野鲤、荷包红鲤、兴国红鲤的快速种类鉴别,为种类鉴定提供遗传学依据。