椭圆叶花锚(Halenia elliptica D.Don)是龙胆科(Gentianaceae)花锚属一年生或者两年生草本植物。龙胆科包括獐牙菜属和花锚属，其中已进行有关植物化学研究的花锚属只有4种：Halenia corniculata，H.elliptica，H.campanulata和H.asclepiadea。我国有该属植物两种，为花锚H.corniculata和椭圆叶花锚H.ellipitica D.Don。椭圆叶花锚是我国臧族、羌族民间常用草药之一，用于治疗急性黄疸型肝炎，胆囊炎、头晕头痛等症。以花锚为主药材研制、开发的治疗肝胆系统疾病的成品藏药，具有疗效稳定，效率高等特点。　　 本文针对藏药龙胆科花锚属(Halenia Borkh)椭圆叶花锚，建立椭圆叶花锚的HPLC指纹图谱，可用于此种药材优劣评价及中成药的质量控制，生产工艺等，为花锚和中成药提供科学的鉴定方法。优化的色谱条件是：色谱柱为AgilentC18(4.6×250mm，5μm)；流动相为A：水一乙酸(100:0.05，v/v)，B甲醇-乙酸(100:0.05，v/v)，C乙腈-乙酸(100：0.05，v/v)，梯度洗脱；流速1.0ml/min；检测波长为程序设置；柱温为25℃。利用HPLC-DAD建立了的反相HPLC指纹图谱，以芦荟大黄素为内标物，确立了32个特征共有指纹峰。对32个共有色谱指纹峰进行ESI-MS定性，结合相关文献确定了部分可能的组分。本工作系统地对85个不同地区的11个居群的花锚样品进行了测定，获得了各居群花锚相对含量，通过相似度计算和地理分布的对比分析，对居群内与居群间的差异进行了统计分析，结果表明，不同地区的花锚间的化学组成具有显著性差异，最后，对各居群的样品进行了聚类分析，结果表明，椭圆叶花锚的组成与其相应的地理分布和海拔等具有一定的相关性。对指纹图谱的建立进行了方法学考察，稳定性、重现性良好，保留时间的相对标准偏差为0.048％。说明该方法准确可靠，可用于椭圆叶花锚指纹图谱的研究。