大豆DNA去甲基化酶GmDMEs的功能解析

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:machao4
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
表观遗传学是指在基因的DNA序列不发生改变的情况下,基因的表达或表型发生可遗传改变的现象。甲基化是DNA的一种化学修饰,是一种相对稳定和可遗传的表观遗传标记,对许多生物过程至关重要。在生物体内DNA甲基化和去甲基化的动态平衡控制着基因表达强度。DME(DEMETER)是DNA去甲基化所需的一种糖基酶,在拟南芥中dme突变体使胚乳中的DNA甲基化升高,并且影响胚乳的发育。在苜蓿中dme突变后会影响根瘤的发育。但大豆中DME蛋白的具体功能尚不清楚。因此在本研究中,以大豆为试验材料,利用CRISPR/Cas9技术构建了 GmDME突变体,并对突变体进行甲基化分析和表型观察,以进一步解析DME的功能。本研究主要结论如下:1、生物信息学分析显示,在大豆基因中存在两个较高相似度的拷贝,GmDMEa(Glyma.20G1 88300)和GmDMEb(Glyma.10G202200),都具有 ENDO3c 结构域和RRM_DME结构域。GmDMEa基因CDS区全长5553bp编码1850个氨基酸,GmDMEb基因CDS区全长4290bp编码1429个氨基酸。DME在植物界是比较保守的,系统进化树分析可知,GmDME蛋白与同为豆科的苜蓿DME蛋白的亲缘关系最近。2、以大豆东农50为实验材料,经RT-PCR显示,DME基因在大豆中的表达具有组织特异性,GmDMEa和GmDMEb均在干种子中表达量最高。3、利用CRISPR/Cas9技术成功构建敲除载体,经遗传转化鉴定得到7种纯合突变体共88株,其中5种为碱基缺失型突变,2种为碱基插入型突变。5种突变体导致移码突变和提前终止翻译。4、田间表型观察:经过比较发现,相比于野生型,突变体植株的株高、分支数、荚数、蛋白含量和油脂含量无明显变化;突变体植株的开花数增加了 56%,种子百粒重增加范围从16.9%到38%;Gmdmeb-2C和Gmdmeb-3C类型突变体植株四粒荚数的百分比分别增加了 37%和 35.8%;Gmdmeb-1C、Gmdmeb-3C、Gmdmeb-5C、Gmdmeb-7C类型突变体植株单株产量分别增加了 37%、29.1%、38%、21%,并且与野生型之间存在显著差异。Gmdme突变体影响了大豆种子的发育,导致大豆种子的百粒重增加。5、经甲基化分析,大豆Gmdme突变体影响了转座子区DNA甲基化水平,并在CHH位点的甲基化水平显著提高。
其他文献
风能作为一种储量大、分布广泛、可再生的清洁能源,其战略价值越来越得到人们的重视。内蒙古自治区境内的戈壁和荒漠数量众多,是我国沙尘天气高发地区,这就导致了在内蒙古地
目的:探讨胰体尾切除术后胰瘘的危险因素及构建预测术后胰瘘发生概率的列线图模型。方法:设置纳入标准及排除标准,回顾性分析2013年01月01日至2019年06月30日期间在浙江大学
燃气轮机是一种融合了各领域知识由大量复杂机构协调配合运行的装置,主要部件有压气机、燃烧室、涡轮三大块,其中在压气机的第一级动叶前有一列静止的叶片,称之为进口导叶(in
随着赣江流域范围内经济快速发展、稀土采矿业的迅速崛起、农业集约化程度的增强以及人口数量的增多,水污染情况日益严重,已经影响到周边居民的正常生活。本文以赣江流域上游
随着全球对能源危机与环境保护问题认识的不断深入,开发与应用新能源成为研究主流,以电力电子装置为基础的开发与应用新能源的微电网系统越来越被重视。本文以微电网逆变器为
近年来,随着公共自行车系统的迅猛发展,其独特的交通流量疏通优势日益展现出来,在广大居民的日常生活中大显身手。与此同时,由于使用需求的激增和运营规模的扩张,系统也逐渐暴露出不少缺陷。比如:高峰时期与高频使用地点车辆周转率不平衡,中心城区与偏远郊区路网流量分配不均、车辆调度难、成本高等问题。这些问题的产生主要是由于部分客流量大的关键节点流量失衡导致的,如何运用科学手段对这些节点合理筛选及优化控制是提高
背景:睡眠时间异常与负面的健康结果有关,特别是在中年人和老年人中。虽然睡眠质量对于良好的生活质量是必不可少的,但在腰椎间盘突出症患者中,睡眠质量并没有得到适当的测量
近年来,人们的生活水平普遍提高,与此同时产生了很多环境污染问题,包括日常产出垃圾的随意丢弃问题,工业上的“三废”问题,农药残留及水环境的污染问题等,严重威胁着人类的生
随着中国经济的不断发展和改革的不断深入,我国的道路交通也在高速发展,道路对于经济发展和改革起到了至关重要的推动作用。但沥青道路经过十余年的服役期后,很多沥青路面出
好氧颗粒污泥(aerobic granular sludge,AGS)因具有众多优点成为了废水生物处理的热点研究技术之一。然而,AGS技术仍存在部分缺陷,如:启动时间长、AGS储存过程中稳定性下降机理不明确、自养硝化颗粒污泥形成条件苛刻且培养时间过长等,限制了该技术的发展应用。因此,对于相关问题的研究,具有重要的实际意义及工程价值。(1)采用选择压和控制污泥龄策略在中试SBR中培养异养颗粒污泥,探