目前现有的关于农民合作组织的研究，大多从国家与社会的视角进行考察，或者从市场的角度来研究，把二者有效结合在一起的研究尚不多见。本论文尝试把国家与社会的架构和市场的因素有效结合，在三者的相互作用下，从发生学的角度比较两岸农民合作组织的形成条件以及发展趋势。在现代社会中，由于资本市场的出现，单个的农民无法应对市场。这时需要国家让渡出一部分权力给社会，建立农民的合作组织，让组织和市场之间实现对接，让社会代替国家实现地方性社会的治理。国家在市场和社会之间充当一种平衡器。　　 本研究首先分别对台湾农民合作组织的缘起进行说明，对台湾农会和大陆农民合作组织的历史进行考察，以期对台湾农会和大陆农民合作组织的现状进行有效说明。探究在国家、市场和社会三者之间，农民合作组织充当了什么样的角色，具有什么样的功能。其次，通过对台湾农会组织的发展历史和共产党执政后大陆农民合作组织的历史进行梳理，并作纵向的比较。以期通过纵向的历史比较，指出台湾农会与大陆农民合作组织的不同。具体包括农民合作组织的限度和效度、成立的前提条件和社会基础以及建构过程和建构方式等方面。第三，对当下台湾农会的发展和大陆农业合作组织的得失进行解释，最后进行理论上的提升。