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目的:研究BRM基因启动子区域的两个插入/缺失多态BRM-1321(rs3832613)和BRM-741(rs34480940)与中国人群肝细胞肝癌(HCC)易感性的关联,并利用基因型-表型关联研究及生物信息学方法探讨多态参与肝细胞肝癌发生的功能及意义。方法:(1)运用生物信息学工具筛选出BRM基因启动子区域内的多态,并从中选取两个具有潜在功能的插入/缺失(Indel)多态位点BRM-1321和BRM-741作为候选多态;(2)基于第一步预测结果,采用病例对照研究方法(796HCC病例和806例正常对照),PCR扩增结合聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对候选多态进行基因分型,Logistic回归统计分析基因多态位点与HCC的关联性,SHEsis软件分析BRM-1321和BRM-741组成的单倍型与HCC的关联性;(3)对发现的阳性关联位点,运用Real-time RT-PCR和Western Blotting方法研究肝细胞肝癌组织、癌旁组织和肝癌细胞系中BRM-1321多态及其单倍型与BRM表达量的基因型-表型关联;(4)运用生物信息学的方法预测多态位点BRM-1321可能结合的转录因子。结果:(1)基因分型结果显示,位于BRM基因启动子区域内的位点BRM-1321和BRM-741具有较好的多态性。 BRM-1321位点6-bp插入/缺失(Ins/Del)的基因型频率在病例组中分别为0.418(Del/Del),0.451(Ins/Del),0.131(Ins/Ins);在正常组中分别为0.540(Del/Del),0.395(Ins/Del),0.066(Ins/Ins)。BRM-741位点7-bp插入/缺失(Ins/Del)的基因型频率在病例组中分别为0.198(Del/Del),0.467(Ins/Del),0.334(Ins/Ins);在正常组中分别为0.228(Del/Del),0.479(Ins/Del),0.293(Ins/Ins)。BRM-1321位点和BRM-741位点在对照组中的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);(2)调整性别、年龄、吸烟、饮酒、HBV感染等主要风险因素后,运用Logistic回归分析的方法对实验数据进行统计分析,统计结果显示:与BRM-1321位点Del/Del基因型相比,Ins/Del基因型和Ins/Ins基因型个体患HCC的风险明显增加(OR=1.47,95%CI:1.19-1.82;OR=2.55,95%CI:1.75-3.72)。BRM-741位点与HCC易感性没有明显关联,然而在吸烟状况的分层分析中发现,在吸烟亚群中BRM-741位点与HCC易感性有明显关联(Pinteraction=0.02),在非吸烟亚群中BRM-741位点与HCC易感性没有明显关联。对BRM-1321位点和BRM-741位点组成的单倍型进行分析,得到了与基因型分析相同的结果,与单倍型“-1321Del/-741Del”相比,含有插入型风险等位基因的两个多态(-1321Ins/-741Ins)组成的单倍型明显增加患HCC的风险(OR=1.59,95%CI=1.33-1.90)。(3)Real-time RT-PCR结果显示,癌旁组织中BRM的mRNA表达量比肝癌组织高2.75倍。BRM-1321位点基因型和相应的单倍型与BRM的mRNA表达有关联,分别以肝癌组织和癌旁组织中BRM-1321位点Ins/Ins基因型组为对照组,Ins/Del基因型组和Del/Del基因型组的BRM的mRNA表达水平分别增高2.30和4.99倍;在Western Blotting结果中,也显示出相同的趋势。与肝癌组织中-1321Ins/Ins-741Ins/Ins单倍型相比,-1321Del/Del-741Del/Del和-1321Del/Del-741Ins/Ins单倍型BRM的mRNA表达量分别增加2.65和9.43倍;在四种常见肝癌细胞系(Huh-7, Hep3B, sk-Hep-1和SMMC-7721)中也观察到了相似的结果,与具有-1321Del/Del-741Del/Del单倍型的sk-Hep-1细胞系相比,具有-1321Del/Del-741Ins/Ins单倍型的Huh-7, Hep3B和SMMC-7721细胞系的BRM的mRNA表达量明显增加;在Western Blotting结果中,也显示出相同的趋势。(4)生物信息学预测结果提示,有些转录因子只能与BRM-1321插入型多态结合,不能与BRM-1321缺失型多态结合。结论:(1)病例对照研究数据分析结果显示,中国人群中BRM-1321多态与HCC易感性存在显著关联;BRM-741多态与HCC易感性没有显著关联,但在对吸烟状况的分层分析中发现,在吸烟亚群中BRM-741位点与HCC易感性有明显关联(Pinteraction=0.02),在非吸烟亚群中BRM-741位点与HCC易感性没有明显关联;(2)肝癌组织和癌旁组织中BRM的mRNA和蛋白表达量与BRM-1321多态及其单倍型之间存在显著的基因型-表型关联;(3)BRM-1321多态可能通过影响特定转录因子与其靶基因(BRM)启动子的结合,从而实现对BRM表达的调控,进而参与HCC发生。(4)考虑到BRM不仅可以影响肿瘤细胞分化程度、肿瘤浸润和淋巴转移等病理过程,而且可以影响肿瘤与机体之间的相互作用,我们的实验结果提示BRM有望成为研究HCC发生机制、早期诊断以及生物治疗的新靶点。