急性髓系白血病中hnRNP家族和SR家族剪接因子相关生物学特征分析及SRSF10-HDAC9轴的机制研究

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ytx200909
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背景:急性髓系白血病(acute myelocytic leukemia,AML)是造血干/祖细胞恶变而引起的血液系统恶性肿瘤,发病机制尚不明确。AML患者预后差,五年存活率低于30%。因此,探索新的生物标志物有助于AML患者的临床诊断、预后评估和个性化治疗指导。RNA的选择性剪接(alternative splicing,AS)是形成蛋白质多样性的基本生物过程,但许多非特征性的AS事件被证实参与了AML的发生与发展。剪接因子(splicing factor,SF)作为调控AS事件发生的工具,其异常改变会影响剪接调控的过程,探索SFs与AML患者临床特征和生物学过程的关系具有重要的意义。目的:本研究聚焦于经典的核内不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNP)家族与精氨酸和丝氨酸富集蛋白(serine/arginine-rich protein,SR)家族剪接因子,基于多组学探索它们与AML临床病理因素和生物学行为的关系。方法:我们分析了32个SFs在TCGA数据库AML患者样本中的遗传变异景观,并基于SFs的表达使用一致性聚类算法对AML患者进行无监督聚类;进一步比较不同剪接调控模式间预后、临床病理信息、免疫细胞浸润、免疫功能和信号通路活性等特征的差异。我们还使用癌症基因组计划(Cancer Genome Project,CGP)数据库来预测不同剪接调控模式样本对常用治疗药物的敏感性,并通过与其他免疫治疗的数据进行比较,预测AML患者对抗PD-1和抗CTAL4的反应。此外,我们构建了一个预后风险评分模型来预测AML患者的总生存期(OS)。最后,我们通过实验分析了SRSF10与AML细胞促癌表型的关系以及对下游靶基因HDAC9的调控机制。结果:与正常样本相比,大多数SFs在AML样本中表达上调并与预后不良相关。四种剪接调控模式中,聚类D患者预后最好,聚类A和聚类B次之,聚类C最差。聚类A中SFs普遍低表达,促癌信号传导通路显著激活;聚类B中SFs一致性高表达,遗传信息表达相关通路高度富集,显示出增殖活跃的表型;聚类C伴随高富集评分的炎症免疫和能量代谢相关通路,高浸润比例的单核细胞、中性粒细胞和M2巨噬细胞,以及高表达水平的免疫检查点。药物预测表明,聚类B比聚类A对阿糖胞苷、阿霉素和米哚妥林更敏感;相比于聚类C,阿糖胞苷和米哚妥林对聚类D患者更适用。免疫治疗预测聚类C患者对抗PD-1治疗反应更高。我们构建的风险评分模型能准确预测AML患者预后,风险评分较高的患者OS显著缩短。SRSF10的表达上调特征在临床样本中得到证实,SRSF10促进AML细胞增殖,抑制凋亡,并影响促癌基因HDAC9全长和截短亚型转录本的剪接。结论:剪接调控模式的分析可以帮助我们更好地了解AML患者肿瘤微环境的差异,并指导临床用药和预后预测;同时SRSF10可以作为AML的一个潜在治疗靶点和生物标志物。
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背景及目的:环孢素A(CsA)是一种在临床上广泛运用于肾脏、心脏、肝脏等器官移植的强大免疫抑制剂,能够很大程度降低器官移植后排斥反应的发生,除此之外,环孢素A也常与肾上腺皮质激素联合使用治疗免疫相关疾病。但随着环孢素A的广泛运用,临床使用时有许多副作用,如临床常见的肾毒性、肝毒性等,但它是否具有导致心脏毒性尚不明确,且机制不清。因此,我们利用斑马鱼作为模式动物评估CsA对胚胎心脏发育的毒性。方法:
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目的:同型半胱氨酸(Homocysteine,Hcy)是人体必须氨基酸甲硫氨酸代谢过程中重要的中间产物。有研究发现,在心血管疾病患者血浆Hcy升高的同时,往往伴随血铜升高,并且血液中Hcy联合铜离子(Cu2+)会导致血管内皮功能障碍。然而,Hcy和Cu2+对心肌细胞的影响尚不清楚。本研究中,我们将探讨Hcy联合Cu2+引起心肌细胞死亡的机制。方法:1.检测心肌细胞凋亡实验:通过Western bl
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目的:Klotho蛋白是一种新型的与抗衰老相关的蛋白,在脑内高度表达,对神经元NMDA受体功能具有重要调控作用。最近的研究表明,除了延长寿命,Klotho可以增强正常啮齿动物海马依赖的学习和记忆功能,在许多神经精神系统疾病中参与调节过程。然而Klotho表达含量改变与抑郁症的内在发病机制间的关系尚不清楚。此次研究目的是探索Klotho表达水平与小鼠抑郁样行为存在的潜在联系。方法:(1)小鼠遭受慢性
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<正>2021年3月30日,教育部印发《关于大力推进幼儿园与小学科学衔接的指导意见》,提出了一系列有针对性的重要举措,全面推进幼儿园和小学实施入学准备和入学适应教育,减缓衔接坡度,帮助幼儿顺利实现从幼儿园到小学的过渡。在幼小衔接工作中,我园紧扣工作实际,以实际问题为导向,实施“12345”机制,助力科学幼小衔接。
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目的:1.研究高毒力肺炎克雷伯菌的临床分布、耐药现状及分子流行病学特征。2.研究qnrS1质粒阳性高毒力肺炎克雷伯菌的耐药、毒力及分子流行病学特征。3.研究高毒力肺炎克雷伯菌中qnrS1质粒的适应性代价及流行传播机制。方法:1.收集南昌市某大型三甲教学医院2017年1月至2020年11月临床各种标本分离的肺炎克雷伯菌2746株作为实验菌株,并剔除同一个患者相同部位的重复菌株。应用Vitek 2 C
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研究目的达托霉素属于环脂肽类抗菌药物,是一种具有很强杀菌作用的细胞膜活性化合物,主要适用于治疗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌引起的复杂感染。目前金黄色葡萄球菌对达托霉素的耐药机制未明。研究金黄色葡萄球菌对达托霉素的耐药机制既有助于为新药物的开发提供思路,也有助于研究出针对耐药靶点的方案进一步减缓细菌耐药的发展。本研究通过体外诱导金黄色葡萄球菌对达托霉素产生耐药性,对耐药菌株的表型特征及耐药机制进行研究。
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第一部分:天竺葵素在体外对小鼠软骨细胞炎症和表型的影响及其机制的研究目的:骨关节炎是中老年人常见的疾病,主要临床表现为关节畸形、疼痛和功能障碍,其发病与软骨细胞外基质的破坏和炎症反应息息相关。炎症和炎症反应是引发和加剧骨关节炎发生发展的关键因素,在这些炎症因子中,白细胞介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β)被认为在骨关节炎的病理发展中起到关键作用。核转录因子κB(NF-κB)是一种
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