偃麦草属(Elytriga Desv.)的长穗偃麦草(Et.elongata(Host)Nevski)和中间偃麦草(Et.intermedia(Host)Nevski)是普通小麦(Triticum aestivum L.)的重要野生近缘种，具有抗病抗逆、高籽粒蛋白含量等多种可用于改良小麦的优良基因。通过染色体工程方法创制小麦-偃麦草代换系、附加系和易位系等染色体工程材料，进而挖掘和利用其优异基因，对于丰富普通小麦的遗传多样性和品种改良具有重要意义。
　　本文利用普通小麦缺体-四体系列材料分别与3个小偃麦部分双二倍体——小偃784(2n=8x=56，AABBDDEE或AABBDDStSt)、中5(2n=8x=56，AABBDDXX)和8802(2n=6x=42，AABBEE)杂交和回交，在后代群体中利用基因组原位杂交(GISH)技术筛选代换系等含有偃麦草染色体成分的远缘杂种材料。进一步利用荧光原位杂交(FISH)技术结合SNP分子标记技术分析染色体组成，准确识别代换系材料中被代换的小麦染色体和偃麦草染色体的同源群归属。通过抗条锈病鉴定，挖掘和定位偃麦草的抗病基因。本研究的目的是为小麦染色体工程基础和应用研究提供较系统中间材料和挖掘偃麦草的抗病基因。获得的主要结果如下:
　　(1)利用GISH技术，以偃麦草基因组DNA为探针，对2428份小偃麦杂种BC1F4或F5代材料进行鉴定，获得了121份代换系材料，112份附加系材料和34个易位系材料。在121份代换系材料中，67份来自于小偃784，46份来自于中5，8份来自于8802。
　　(2)利用FISH技术对小麦-偃麦草的代换系进行了染色体组成分析，共明确了94份代换系材料的染色体组成，其中定向代换的材料共62份，占66.0％。在这94份代换系中，来自小偃784的有59份，涵盖了除4B、5D和7B以外的18条染色体;来自中5的有32份，共代换了2A、3A、4A、6A、7A、1B、2B、4B、5B、7B、2D、3D、4D、6D和7D共15条染色体;来自8802的代换系仅得到3份，全部为6D代换系。
　　(3)通过E基因组特异的SNP标记分析，明确了46份来自小偃784的代换系中的长穗偃麦草染色体的同源群归属，由此确定了它们与染色体组成。同时可见，有5份材料检测出来自两个不同染色体上的阳性标记，表明该染色体在传递过程中发生重组。
　　(4)利用小麦条锈菌生理小种CYR33对所有含有外源染色体或染色体片段的材料进行苗期抗病鉴定，获得了38份对小麦条锈病生理小种CYR33免疫、近免疫或高抗的材料，其中包括19份代换系，15份附加系和4份易位系。根据小偃784后代代换系材料的抗病结果可知，被1E代换的3份代换系材料与被3E代换的5份代换系材料均表现为免疫、近免疫或高抗，由此可以推断小偃784的抗条锈小种CYR33的抗病基因位于1E与3E上。