如今,我国处于房地产开发建设、市政基础设施建设的鼎盛时期,建筑业发展迅速,但由于法律法规不完善,行业中违规操作等现象严重,建设工程合同纠纷屡屡发生。建设工程合同纠纷发生的原因多种多样,而且纠纷当事人关系复杂、内容专业性强、审理困难。如果不能通过恰当的纠纷解决方式及时解决纠纷,容易导致工程的效率和质量低下。因此,对纠纷当事人来说如何合理地选择纠纷解决方式,对于政府部门来说如何促进纠纷有效地解决是亟待解决的问题。本文通过实证分析我国建设工程合同纠纷解决方式选择的重要影响因素,并结合鲁宾斯坦讨价还价理论分析建设工程合同纠纷协商解决机制。首先,总结分析国内外关于建设工程合同纠纷解决机制研究的文献,提出本文研究的出发点,同时分析纠纷的特征、纠纷产生的原因、不同纠纷解决方式的优缺点以及我国的外部制度对纠纷解决方式选择的影响,并应用法经济学理论探讨不同纠纷解决方式的经济合理性。然后,提炼影响我国建设工程合同纠纷解决方式选择的因素,通过问卷调查收集数据,采用SPSS16.0进行因子分析,得到影响我国建设工程合同纠纷解决方式选择的潜在因子,并根据建设工程领域纠纷解决的实际情况,对数据分析结果进行解释。最后,建立以仲裁为外部选择的鲁宾斯坦讨价还价模型,理论分析建设工程合同纠纷协商解决机制。本文通过实证研究得到6个我国建设工程合同纠纷解决方式选择的潜在影响因子,按照重要性从大到小排列,依次为长期稳定发展、当事人的地位、成本、制度规范、约束力和社会习俗；以仲裁作为外部选择的鲁宾斯坦讨价还价模型从理论上明确了工程项目中承包商和业主就索赔金额形成纠纷时,双方对索赔金额的预期差异以及仲裁成本对和解成立的影响机制,并分析通过第三方调解更新纠纷双方对仲裁结果的预期,从而改变协商和解成立的可能性。