基因芯片技术是近年来发展迅速的高科技生物技术，它将大量的探针分子固定到固相支持物上，借助核酸分子杂交的特性对DNA样品的序列信息进行高效的解读和分析。它可用于DNA测序、基因表达图谱的分析及突变检测等很多方面，具有广阔的潜在应用价值。基因芯片实验的杂交动力学是基因芯片研究中重要的方面之一，研究这一范围有益于优化芯片设计，得到更加可信的实验结果很有帮助，使研究者可以建立更加稳定的实验系统，对于实验结果进行更加科学的分析。 本文在原有的异质杂交模型基础上，分析其预测结果和实验结果的符合状况，得出探针和靶标成功进行杂交反应的概率不是定值，而是随着时间变化而变化，并拟合出它的表达式。另外，通过热力学分析，建立DNA杂交稳定的热力学判据，求得最佳探针分子浓度。探针分子浓度一旦超过一定范围，就会违背热力学稳定性，不再符合预期结果。本文还讨论了实验温度周期性变化以及探针密度不均匀情况下的杂交反应状况。总的研究结果表明，概率修正后的新模型和实验结果之间有更好的一致性，而且对于不同的反应体系，即不同的探针、靶标分子应该有不同的杂交模型与其相对应。