肢体缺血预处理对心肌MAPK相关基因表达谱变化的影响

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zzfsunny
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
【目的】应用全基因表达谱芯片技术分析肢体缺血预处理过程中心肌基因差异性表达,了解肢体缺血预处理对心肌MAPK相关基因表达谱变化的影响。【方法】采用随机数字法,随机分为两组每组5只,肢体缺血预处理(limb ischemiapreconditioning, LIP)组(LIP组)和空白组(C组)。LIP组用橡皮筋套住大鼠右后肢根部,缺血5min,再灌注5min,共3个循环。C组大鼠麻醉后仅进行假处理。观察24h肢体缺血预处理后24小时即LIP延迟相,分别取LIP组和C组的左心室的心尖部厚度在0.5㎝以下,重50-100㎎的组织,放于RNA保存液-80℃保存。提取总RNA进行扩增、3H-吲哚菁类染料(cyanine-3,Cy3)标记,与Agilent4x44K大鼠全基因组表达芯片杂交,荧光扫描,经基因本体(GeneOntology,GO)分析、Pathway分析数据处理,筛选出MAPK信号通路的差异表达基因,用实时定量PCR分析验证部分与MAPK信号通路相关的差异表达基因,并结合通路分析来探索MAPK信号通路与肢体缺血预处理的内在联系。【结果】芯片筛选结果显示差异基因为倍数变化大于2倍(fold change cut-off≥2.0)有1364个。GO分析结果显示,生物学过程(Biological Process, BP)中外界刺激在其差异表达基因中所占比例最大;分子功能(Molecular Function, MF)相关的差异基因中最多的是结合受体基因;细胞组分(Cellular Component,CC)中细胞通道相关基因变化比较显著。Pathway分析结果中显示上调通路有10条;下调通路有10条,其在MAPK信号通路中,上调的基因有19个,下调的基因有15个。MAPK通路中Map3k6、Il1r2、Grb2、AKT和HSP变化倍数超过2倍,其Map3k6变化最显著。RT-PCR验证结果与芯片检测的变化趋势一致。【结论】以京都大学基因组和基因百科全书数据库(Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes,KEGG)为依据,对大鼠LIP延迟相心肌基因表达通路分析,LIP组与C组心肌基因表达存在多个上调和下调基因的差异;P38MAPK信号通路中基因AKT、HSP在LIP延迟相对心肌作用起正向调控作用;ERK1/2信号通路中基因Grb2在LIP延迟相对心肌作用起正向调控作用;经典的MAPK信号通路中基因Il1r2在LIP延迟相对心肌作用起负向调控作用。即LIP延迟相对心肌作用过程中MAPK信号通路对起双重调控作用。
其他文献
目的:探讨腋-股/腘动脉旁路术在治疗主-髂动脉闭塞性疾病的手术适应证、技术特点、并发症及评估其疗效。方法:回顾性分析2005年1月1日至2013年1月1日我院血管外科收治的35例主
目的:对带锁髓内钉(Intramedullary Interlocking Nail, IIN)与钢板治疗成人胫骨远端骨折的并发症、手术时间、住院时间、完全负重时间及愈合时间进行Meta分析,为制定成人胫骨
简述热镀锌锅种类及加热方式、热浸锌生产工艺、飞溅锌的原因及其预防方法。介绍半自动移动式炉盖和固定液压开闭式炉盖的制作、安装、操作。 Brief description of the typ
目的探讨电视胸腔镜辅助下心脏微创二尖瓣成形术的技术特点及应用价值。方法在手术效果、创伤程度以及节省资源等方面,将41例电视胸腔镜辅助下心脏微创二尖瓣成形手术患者(微
目的观察大鼠嗅鞘细胞(olfactory ensheathing cells, OECs)和人脐带间充质干细胞(human umbilical cord-mesenchymal stem cells, hUC-MSCs)在体外环境中混合培养一段时间后细胞
互联网时代的到来,加速了商业环境的变革速度和规模,逼迫企业不断自我变革。然而在变革的道路上,很多企业由于低估了变革的阻力,没有在企业内部系统化推进变革,最后以失败告
心血管疾病发病率高、死亡率高,严重损害人们健康,由于间充质干细胞分化心肌细胞、分泌保护因子的作用,干细胞移植成为治疗心血管疾病有希望的方法。虽然以往各种体内外研究
目的:本实验收集纤维化肝组织和正常肝组织,对肝脏组织标本做HE染色和Masson染色,光镜观察组织的纤维化程度;Real-time PCR检测肝组织中I型胶原、Ⅲ型胶原、Hic-5、α-SMA、TGF-
目的:探讨颈椎后路单开门铆钉内固定在治疗多节段脊髓型颈椎病的短期疗效。方法:回顾性分析2011年1月~2013年3月,新疆医科大学第六附属医院脊柱外科应用颈椎后路单开门铆钉内固
目的:探讨经颈后正中入路一次完成寰枢关节松解、复位、内固定融合治疗难复性寰枢椎脱位的理论可行性。方法:1.通过MRI对实验动物术前及术后各时间寰椎上缘至枢椎下缘脊髓进行