生物医药制造业是近年来我国成长最迅猛、发展最活跃的主要产业方向之一,经济全球化、疫情常态化和医药卫生体制改革为生物医药产业既带来机遇也带来挑战,未来几年生物医药产业或将发生重大变革、医药企业面临重新“洗牌”。医药企业要想获得长远发展,提升行业综合竞争力,就必须主动创新,加大研发投入,掌握核心技术。当下,生物医药企业在合理规划研发项目、正确使用研发经费、充分利用国家相关科技及税收政策方面存在规范性不足,导致影响企业盈余质量,因而,研发投入的合理化、合法化、科学化的处理成为目前亟待解决的问题。本文灵活运用文献研究法与个案分析法,通过研发投入对盈余质量进行影响分析,挖掘医药企业优化研发投入区分、识别、确认、归集,提高盈余质量,包括引导其他医药企业通过优化布局研发投入,提高产品研发力和核心竞争力,助力盈余质量呈现良好发展趋势。正文分为六个部分。第一部分是绪论,主要简单阐述本文选题的研究背景及研究意义,梳理国内、外专家学者关于研发投入和盈余质量的文献,介绍本文的研究方法、主要思路和主要内容,阐述本文研究的可能创新之处和局限;第二部分是相关概念和相关理论部分,主要介绍研发投入、盈余质量的基本概念和技术创新理论、信息不对称理论、投入产出理论,为下文的案例分析及结论建议打好理论基础;第三部分是医药制造企业研发投入和盈余质量分析,分析我国医药制造企业态势良好的盈余情况和研发投入增长快、空间大、龙头效应显著的现状,挖掘研发投入的宏微观影响因素;第四部分是东阳光药案例分析部分,简要介绍东阳光药的基本情况和研发投入情况,并将研发投入对盈余质量的影响进行定量分析、定性分析和负面评价;最后是建议措施和结论两个部分。研究结论如下:（1）研发投入的合理确认有利于增强盈余质量的平稳性;（2）税前加计扣除的充分运用有利于提高盈余质量的应计利润质量;（3）研发投入的科学管理有利于增强盈余质量的可预测性;（4）研发投入的效率提高控制有利于增强盈余质量的持续性;（5）研发投入的规范披露有利于增强盈余质量的价值相关性。