转移性小鼠乳腺癌细胞基因组中具有转录活性DNA片段的捕获

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lsssml1990
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乳腺癌是造成世界上女性癌症高发病率和死亡率的恶性肿瘤之一。随着人类基因组测序的完成,特别是近年来基因组中非编码RNA的发现,这些研究结果表明,基因组中还有大量的与生命相关,特别是与疾病相关的基因有待被发现并进行研究。因此,本项研究采用启动子捕获技术挖掘新的癌症相关基因。以转移性的小鼠乳腺癌细胞为模型,将细胞的基因组DNA随机酶切片段与报告基因载体连接,通过检测报告基因活性获得插入DNA片段的转录活性,从而得到具有转录活性的DNA片段,为进一步确定其所驱动的相应基因的发现建立基础。主要试验及结果如下:1.构建小鼠乳腺癌细胞4T1基因组DNA与无启动子载体pCpGfree-basic的随机载体库,获得706个随机质粒并构建了报告基因分泌型碱性磷酸酶(secreted embryonic alkaline phosphatase, SEAP)阳性对照的载体;2.将获得的706个随机文库的质粒转染到24孔板中的4T1细胞中,取转染36h后的上清,检测报告基因SEAP的活性,确定阳性质粒;3.将得到的阳性质粒送去测序,得到序列后,对其进行序列的比对分析,确定其在染色体的具体位置及其上下游的是否有调控的基因。根据试验结果,该试验得到15个具有转录活性的阳性质粒,在这15个阳性质粒中,有cbfa2t3基因的启动子,还有7个位于不同基因的内含子中,其余则位于DNA的非编码区。这对后续与乳腺癌相关的癌基因的研究提供基础及参考。
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