面向生物医学数据共享的方法元数据描述与互操作研究

来源 :曲阜师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:redbattleline
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
在全球推进科学数据开放共享的背景之下,科学研究方法的记录与共享有助于推动科学研究成果的可验证性和科学研究的可重复性,进而提升科学数据共享的质量。当前新冠疫情蔓延给生物医学研究领域带来全球性挑战,也对该领域科学数据共享提出了更高的要求。通过对科学数据相关研究方法进行高质量的元数据描述,实现不同数据仓储之间的方法元数据互操作,有助于提高科研转化效率,对于应对全球疫情具有重要的现实意义。本文以方法元数据为主要研究对象,结合信息组织理论、元数据生命周期相关理论和集成信息服务理论,以生物医学领域为例,对生物医学领域元数据标准中方法元素的设计以及数据仓储中方法元数据的应用现状进行调查,分析科学数据相关研究方法在描述、记录和共享中的现存问题以及改进方向,以“科学环”理论和开放科学相关准则为基础,构建方法元数据内容框架,最后从元数据功能拓展的角度,使用本体技术来验证方法元数据的可互操作性。本文从新冠疫情、生物医学数据共享和开放科学发展的背景出发,通过文献调研,归纳总结方法元数据相关定义,并对科研方法过程、元数据生命周期等相关理论进行分析。其次,从标准的选择、方法元素的选择以及约束条件等3个角度,对生物医学领域的科学元数据标准,以及标准中方法元素的设计现状进行调查和分析。在此基础上从方法元数据描述的数据来源、方法元数据描述的提供主体以及描述的实现方式等3个方面对生物医学科学数据仓储的方法元数据描述现状进行调查分析。通过上述调查,得到现有方法元数据信息内容和元素语义,并分析方法元数据描述中阻碍数据共享的现存问题,以此为基础提出改进方向。而后,从科研方法过程的相关理论出发,结合元数据标准和应用调查中得到的方法元素语义,构建通用的方法元数据框架和元素,从方法标识信息、研究对象信息、研究指标信息、资料收集方法信息、资料分析方法信息、研究工具信息等6个维度构建科研方法信息框架和40个内容元素,以期适用于一般科学研究过程中的方法描述和著录。最后,使用本体技术开展方法元数据互操作,以前述构建的科研方法信息框架和方法元素为基础构建本体类,定义元素间的关系属性,构建不同元数据标准和数据平台间方法元素的语义关联,以前述调查的生物医学领域数据仓储为例,验证该通用方法元数据模型的可互操作性,为科研方法数据跨平台集成检索提供参考。
其他文献
儿童友好城市与儿童友好社区建设有助于促进儿童的发展,成为当前国家推动儿童福利工作的重要方向。儿童的社区参与对儿童友好社区建设无疑起到正功能,但是目前儿童的参与机制仍然不健全、参与渠道仍然不通畅;虽然各社区在进行社区营造时也考虑到了儿童的需求,但大多是标签化、自以为是的“儿童友好”,儿童友好并不只是成人向儿童单向给予的友好,应该切实考虑到儿童的需求,由儿童自己发声才能真正了解儿童需求;因此,如何从平
学位
社区卫生环境是社区形象和居民素质的重要标志,也是一个社区精神文明程度以及思想观念意识的另一表现。随着城市化进程不断的深入,居民的生活质量有了较大的提升,在日常生活当中产生的垃圾也随之增加,但居民对卫生与环境的保护意识却没有得到及时的转变。城市社区卫生环境问题严重阻碍城市社区的建设和发展,尤其是部分老旧小区卫生监管机制不健全、管理方式单一、基础设施薄弱等原因,造成小区卫生环境“脏、乱、差”问题,已经
学位
现如今,为了响应国家治理现代化体系的建设,全国各地纷纷兴起了多元民主参与社区治理的热潮,居民作为重要的参与主体,也被纳入其中。本文中J小区居民的文化程度处于中等偏上的水平,对社区公共事务的参与态度较为热情,居民的参与意愿也比较高,虽然他们具有一定的参与意愿和参与意识,但是由于居民社区参与的层次较低、社区居民缺乏相应的知识储备、社区居民参与机制尚未构建、社区工作人员的专业工作能力不足、社区居委会的日
学位
《国家儿童肿瘤监测年报2020》显示,白血病为儿童患病比例最高的病种,占比57.21%,白血病患者的五年生存率为25.4%。面对这些逐年增多且数量庞大的白血病患儿,不仅需要更新和提高医疗救治手段对他们的身体进行救治,更要发展专门针对白血病患儿的其他社会服务。医务社会工作者作为独立于医患之外的第三方,能够通过专业的方法和技巧来促进白血病患儿心理问题的改善。基于此情况,本研究对Q医院血液科白血病患儿进
学位
目的:通过对《伤寒论》原文的梳理分析,探讨张仲景对有关火郁证的辨治理论与方法,总结出《伤寒论》火郁证治的特点和组方用药规律,为临床多角度辨治火郁证提供思路,进一步提高经方治疗火郁证的临床疗效。方法:以文献研究为基础,结合理论分析,对《伤寒论》中六经辨治火郁证的理论与方法进行探讨;运用数据统计分析的方法,对筛选出的适用于火郁证治疗的经方使用中医传承辅助平台综合分析其配伍应用规律。结果:三阳病火郁部位
学位
癌症的罹患不仅影响人生理健康,在心理上也会给患者造成巨大的压力。近年来,乳腺癌患病率提高,患者的数量快速增加,女性群体是乳腺癌病症最直接的受害者。与其他癌症相比,乳腺癌的治疗方式有可能改变女性的部分生理特征,更容易导致女性在家庭、社会、性别角色等方面心理上的认知偏差和挫折感,因此对乳腺癌病患的预后来说,医学治疗、生理照护相对来说容易达到预期,而在前两者基础上的心理照护则会面临着较多的困难,也更为重
学位
随着经济社会发展和老龄化加深,传统的养老方式越来越难以满足老年人的多元化需求,探索新的养老方式成为必然。本研究以J社区低龄老人支持高龄老人的实践为例,探索社区互助养老的新方式,旨在搭建社区低龄老人和高龄老人之间的互助支持网络。本研究聚焦昆明市J社区的低龄老人和高龄老人之间在养老过程中的互助支持实践,运用定性研究和定量研究相结合的研究方法,采用问卷调查、电话访问、入户探访等方式收集研究资料,并以社会
学位
2019年10月25日,中共中央国务院印发的《“健康中国2030”规划纲要》指出,要以人民为中心,以基层建设为重点,以改革创新为动力,建立覆盖城乡居民的中国特色基本医疗制度。而我国是一个多民族的国家,各民族经济状况和医疗卫生发展状况很不平衡,再加上少数民族自身生活在较为封闭的环境中,长年以来已经借由对文化、行为、生活方式的不断积累和改变,形成了十分特别且具有本民族特征的少数民族文化,因此,在少数民
学位
在互联网及社会化媒体的带动下,在线评论的爆发式增长对众多领域产生了深刻影响。导师评价网站及平台载有大量在读研究生、毕业研究生对导师的评论,这些评论为构建导师画像提供了丰富、动态的信息;同时,当前成熟的大数据挖掘技术为分析在线评论提供了有力的技术与方法支撑。挖掘在线评论中导师的动态、静态和显性、隐性信息,能为准研究生选择导师、确定研究方向提供参考;通过量化导师在线评论的情感强度,能够帮助导师了解教研
学位
学术期刊是知识传播与交流的重要载体,在促进学术交流、科研人才培养、科技发展与创新中发挥着重要作用。目前,学术期刊评价已成为科学计量学领域一个重要的研究方向,科学评价学术期刊影响力有利于提升期刊的质量与竞争力,促进知识的交流与传播,推动科技的创新与进步。SCI期刊评价体系的创建使影响因子等单一引文指标在较长的一段时间内处于国际期刊评价的领导地位。然而,单一引文指标存在评价单一性和片面性的不足,多数学
学位