蛋白质是生命体的重要组成成分,是生命活动最主要的实施者。蛋白质的功能大多通过与配体如生物大分子的相互作用实现,某些结构域在其中扮演关键角色。研究这些结构域的结构对于阐明其作用机制及进一步揭示全蛋白的功能机制是必不可少的。在本课题中,我们选取了几个参与重要蛋白与配体相互作用的结构域,即酿酒酵母的Rtfl-Plus3、Rtfl-HMD及布氏锥虫中一个未知功能蛋白的PDZ结构域,对其结构进行了初步研究,以期解析高分辨结构,为揭示其作用机制和在全蛋白功能中扮演的角色打下基础。(Ⅰ)Rtfl是转录延伸因子PaflC中的重要组成部分,通过自身的几个独立的功能结构域经由不同的途径影响转录过程。目前Rtfl的具体功能机制尚不明确。本课题中我们重组克隆、表达和纯化了酿酒酵母Rtfl的两个主要参与配体相互作用的结构域Plus3和HMD,并用圆二色谱(CD)和核磁共振(NMR)等对其结构进行了初步研究。我们已基本确定了异源重组制备该两个结构域并对其进行多维NMR研究的合适的实验条件,为进一步解析其三维结构和揭示其功能机制打下了基础。(Ⅱ)PDZ结构域是介导蛋白与蛋白相互作用的重要结构域之一,能够识别靶蛋白C-末端的序列。PDZ结构域能够参与多样性的生物过程如：胞内运输、离子通道以及信号转导等。利用生物信息学的方法,我们在布氏锥虫基因组数据库中发现几个含PDZ结构域的蛋白。在本课题中,我们重组克隆、表达和纯化了这几个PDZ结构域,并对其中一个通过NMR方法对其进行了初步结构研究,以期为进一步认识其功能机制作出贡献。该’PDZ结构域的主链和部分侧链化学位移的认证已完成,CSI二级结构分析显示其由8个p折叠片和一个a螺旋组成,与经典的PDZ结构域的结构组成有一定的差异。布氏锥虫属于低等的真核生物,其PDZ结构域结构的解析,一方面可对其相关生命活动机制的阐明打下基础,另一方面可为揭示PDZ结构域的进化提供线索。