部分受保护杨树品种DNA指纹数据库的构建

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我国林木产业发展迅速,特别是近几年来,培育出了大量品质优良的新品种杨树。这些新品种杨树在杂交育种过程中,从品种形态上鉴别它们变得越来越困难,给杨树品种的审定和保护工作带来许多困难,因此为适应保护这些杨树品种信息的需求,更加方便快捷的鉴别这些新品种,建立以杨树品种指纹信息为主要内容的指纹数据库已成为当务之急。本试验搜集了63个受保护杨树品种,并将其SSR分子标记的结果统计整理收录到网络数据库当中,以这63个受保护杨树品种得到的数据为基础初步建成了杨树DNA指纹数据库。同时介绍了DNA指纹数据库的建成原则,并对其创新性及用户需求、可行性和应用前景进行了具体分析,为今后指纹数据库的扩容、维护与应用提供依据。主要研究结果如下:(1)通过对CTAB和试剂盒法(试剂盒由张家口赛诺生物科技有限公司生产)两种不同DNA提取方法比较和优化,证明采用CTAB所提取的杨树DNA在浓度和纯度方面结果好于采用试剂盒法所提DNA浓度和纯度,故采用CTAB法提取杨树品种DNA,可用于SSR分析。(2)利用SSR分子标记技术构建63个受保护杨树品种的指纹图谱和SSR指纹数据二维码。使用经过筛选的18对SSR引物对63个受保护杨树品种进行分析,扩增出74个位点,其中100%为多态位点,平均每条引物1.17个位点,扩增位点数目在3~5之间,多态性信息含量(PIC)值变幅为0.43~0.69,平均为0.559。依据毛细管电泳获得的峰值图可对63中受保护杨树品种进行UPGMA法0-1聚类分析,得出遗传距离在0.0~0.50之间,且18对引物的组合能够将63个受保护杨树品种一一区分开,但是并没有依据白杨派和黑杨派的分类完全区分开。依据扩增出来的各位点峰值及引物信息构建了63个受保护杨树品种的图谱代码。(3)根据SSR试验结果整理出5481条片段信息,另外加上树种、品种及引物信息,本数据库总共搜集整理了近万条数据信息。经过繁杂的数据整理工作,现已将全部数据都上传至DNA指纹数据库(网址:http://10.10.191.23)的后台,并进行了运行调试,此DNA指纹数据库可以正常使用。
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