【摘 要】
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甘蔗梢腐病遍布世界热带和亚热带地区,给甘蔗产区带来重大产量损失。甘蔗梢腐病是一种危害甘蔗生产的流行性真菌病害,由镰孢菌复合体（Fusarium Species Complex,FSC）,甘蔗镰刀菌（Fusarium sacchari）、Fusarium andiyazi、轮枝镰刀菌（Fusarium verticillioides）和层出镰刀菌（Fusarium proliferatum）引起。本
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甘蔗梢腐病遍布世界热带和亚热带地区,给甘蔗产区带来重大产量损失。甘蔗梢腐病是一种危害甘蔗生产的流行性真菌病害,由镰孢菌复合体（Fusarium Species Complex,FSC）,甘蔗镰刀菌（Fusarium sacchari）、Fusarium andiyazi、轮枝镰刀菌（Fusarium verticillioides）和层出镰刀菌（Fusarium proliferatum）引起。本研究着重于镰刀菌基因区特异性SNP标记开发及应用,以及F.sacchari和F.proliferatum物理图谱的构建。从我国甘蔗主要产区采集的甘蔗梢腐病病症叶片样品中,分离鉴定出81株病原菌株,利用已报道的引物对这些分离菌株进行遗传多样性和系统发育分析。结果表明,影响我国甘蔗梢腐病主要病原镰孢菌复合体F.andiyazi、F.verticillioides、F.sacchari和F.proliferaturm。利用Illumina和Pac Bio CCS测序技术,对夏季发病优势病原代表菌株F.sacchari CNO1和冬季发病优势病原代表菌株F.proliferaturm YN41进行全基因组测序和组装,以及不同温度条件下生长的F.sacchari CNO1和F.proliferaturm YN41转录组测序分析。基于转录组与基因组序列的比对分析,查找基因区SNP位点。根据F.sacchari CNO1和F.proliferaturm YN41基因组和转录组数据,分别设计了覆盖全基因组的438对和414对SNP-PCR标记。其中筛选到39对和51对特异性SNP-PCR分别能够鉴定F.sacchari和F.proliferaturm,以及能够区分81个菌株,利用特异性SNP标记构建F.sacchari和F.proliferaturm的物理图谱。经对F.sacchari和F.proliferaturm特异性SNP-PCR优化和验证,成功实现对甘蔗叶片和土壤样品的病原检测。综上所述,本研究基于镰刀菌基因区特异性SNP标记开发,建立了一种快捷、灵敏、特异的甘蔗梢腐病病原菌分子检测方法,为相关病害早期诊断、分类鉴定以及监测检疫等提供准确的鉴定技术。
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