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具有卓越营养价值和功能特性的双蛋白体系备受关注。优质动植物蛋白结合实现优势互补的双蛋白科学发展策略已被提出,但现有研究和应用集中在乳蛋白和大豆蛋白,与水产蛋白相关的双蛋白体系研究极少。为此,本研究混合不同质量比的罗非鱼肉和大豆豆粕,通过碱溶-等电点沉淀法制备了罗非鱼分离蛋白（Tilapia Protein Isolate,TPI）、5种罗非鱼-大豆共沉淀蛋白(Tilapia-Soybean Protein Co-precipitates,TSPC3:1、TSPC2:1、TSPC1:1、TSPC1:2和TSPC1:3)和大豆分离蛋白（Soybean Protein Isolate,SPI）,对其营养质量、结构特征及蛋白质组成进行研究,探讨了TSPC较TPI和SPI的优势,并为蛋白质品质的评定提供了参考。主要结果如下:1、TPI、TSPC和SPI的粗蛋白含量均高于90%,且TSPC的基本成分、大部分氨基酸组成和体外蛋白质消化率（in vitro protein digestibility,IVPD）介于TPI和SPI之间。SDS-PAGE电泳显示TSPC包含来自TPI和SPI的蛋白亚基组分。与TPI和SPI相比,TSPC2:1和TSPC1:1的色氨酸、天冬氨酸、甘氨酸、组氨酸和精氨酸含量最高,且TSPC1:1还显示了色氨酸和组氨酸的最高氨基酸评分（amino acid score,AAS）。与其它比例的TSPC相比,TSPC1:1中苏氨酸、缬氨酸、蛋氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、色氨酸和组氨酸的AAS均高于SPI。5种TSPC中,TSPC1:1的体外蛋白质消化率修正的氨基酸评分（protein digestibility corrected amino acid score,PDCAAS）为0.86,营养价值最好。因此,通过碱溶-等电点沉淀法制备的罗非鱼-大豆共沉淀蛋白是平衡罗非鱼蛋白和大豆蛋白的营养质量,开发罗非鱼-大豆双蛋白体系的有效策略。2、TSPC的溶解性和热稳定性均高于TPI。在中性p H条件下,TSPC1:3的溶解度达81.90%,热变性温度为90.30°C。紫外光谱和圆二色光谱的变化表明,TSPC的局部结构不同于TPI和SPI。红外光谱分析显示,在TSPC中同时存在TPI和SPI的结构,其主要的二级结构是α-螺旋和β-折叠,且五种TSPC的结构呈现不规律的变化。TSPC1:1的结构是独特的。相关性分析表明,氨基酸组成影响蛋白二级结构,其中蛋氨酸对α-螺旋的影响最大（R=0.975,p<0.01）,苯丙氨酸对β-折叠的影响最大（R=0.913,p<0.01）。α-螺旋显著影响IVPD（R=0.954,p<0.01）。就溶解性而言,α-螺旋呈显著负相关,β-折叠呈正相关（R=0.743）。因此,TSPC有应用于食品加工的潜力,且二级结构与氨基酸组成、消化率和溶解性密切相关,α-螺旋和β-折叠结构是主要相关因素。3、通过蛋白质全谱分析在TPI、TSPC1:1和SPI中分别鉴定到2222种、5092种和5878种蛋白,其中TSPC1:1独有989种蛋白。与TPI和SPI相比,基因本体（Gene Ontology,GO）注释发现TSPC1:1特有细胞聚集（cell aggregation）和其他生物部分（other organism part和other organism）三种功能;京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）分析显示TSPC1:1特有45条KEGG通路,这些结果说明TSPC1:1能参与更多的生化功能和代谢途径。此外,对TSPC1:1特有各种类型的N-聚糖生物合成（Various types of N-glycan biosynthesis）通路的研究表明,参与该通路的含有Glycos＿transf＿1域的蛋白质（Glycos＿transf＿1 domain-containing protein）和α-1,2-甘露糖苷酶（alpha-1,2-Mannosidase）这两种蛋白属于TSPC1:1独有的989种蛋白。总体分析,TSPC1:1较TPI和SPI在蛋白组成、GO功能和KEGG通路方面都有很大差异,具有更多的生物学功能,值得进一步应用于食品工业。