现代农业科技园区是我国农业发展进入新阶段，引导我国农业向布局区域化、生产专业化、产品标准化、经营一体化、服务社会化、管理企业化等现代农业发展方向转变的一种重要的农业生产形式，为现代农业科技的研发、应用和推广搭建了一个平台，是高新农业技术与农业生产紧密结合的有效载体。经过十来年的发展，取得了明显的成效，为解决“三农”问题，使农民增收、农业增效、农村经济发展，推进农业产业结构调整和农业产业化进程，促进农业现代化发挥了重要的作用。但是园区在运行过程中也存在一些需要认真研究并加以解决的问题，其中最为关键的是如何构建一个系统高效的运行机制，确保园区的正常营运，真正体现园区的特点，展示园区的功能，提高园区的效益，促进园区持续健康地发展。因此对现代农业科技园区运行机制进行系统地研究具有重要的现实意义。 本文从现代农业科技园区发展的现实背景出发，探讨了园区存在的一些带有普遍性的问题，对现代农业科技园区的内涵及类型、特点及功能进行了简要的分析研究，在此基础上，采取实证剖析、归纳总结的研究方法，对园区现行的运行机制的现状进行了评析，提出了构建园区系统的运行机制的对策和思路，以期为准备建立现代农业科技园区和正在建设中的现代农业科技园区的各级政府部门和企事业单位等提供参考。