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介形类隶属于节肢动物门甲壳动物亚门介形纲,是一种小型水生动物,其在生态学、地质学、古生物学及进化生物学研究中具有重要的应用价值,甚至于被一些学者称作“进化生物学中应用潜力非常大的模式动物”。但介形类的基础生物学研究薄弱限制了其在上述领域内作用的充分发挥。本研究针对介形类系统学研究中存在的问题,应用分子系统学的原理与方法开展研究,希望为今后介形类动物的分类提供新的证据。1.无偶斗星介(Cypridopsis vidua)线粒体基因组分析及基于线粒体DNA全序列的介形类系统发育研究本研究利用Long PCR技术获得了无偶斗星介的线粒体DNA全序列,其特征主要包括：基因组全长为16783bp,含有13个蛋白编码基因,22个tRNA,2个rRNA和1个控制区。重链的碱基组成分别为：腺嘌呤(A,36.72%)、鸟嘌呤(G,10.51%)、胞嘧啶(C,15.74%)、胸腺嘧啶(T,37.03%),A+T的含量远大于G+C,说明重链具有很强的碱基偏斜性。控制区的长度相比其他甲壳动物来说较长,为2324bp。在密码子使用中,所有的蛋白编码基因都使用ATN类型的起始密码子,除了ND1和ND4的终止密码子为单个的T之外,其他11个蛋白编码基因都为TAA或TAG。而后,本研究基于重链上的13个蛋白编码基因,应用PAUP软件对介形类与其他“泛甲壳动物”间的系统发育关系进行了分析。最大简约法(MP法)研究结果显示,介形类中的两个主要类群(壮肢亚纲Myodocopa和尾肢亚纲Podocopa)可能不是一个单系群,其中壮肢介与五口类(Pentastomida)和鱼鲺类(Branchiura)间的关系较近,而尾肢介与蔓足类(Cirripedia)聚为一支。根据线粒体基因排列顺序分析,发现尾肢纲中的两个物种无偶斗星介和钏路豆形玻璃介(Fabaeformiscandona kushiroensis)司的线粒体基因排序较为相似,两者更接近于典型的节肢动物线粒体基因排序；而壮肢纲海萤(Vargula hilgendorfii)的进化历程则比这两者复杂得多。2.基于核基因18S rDNA序列的介形类高级阶元系统分类研究本研究还测得了喜盐异星介(Heterocypris salina)、膨大丽神介(Cypretta turgida)、克氏丽星介(Cypria kraepelini)、意外湖花介(Limnocythere inopinata)和达尔文介(Darwinula stevensoni)等5个物种的18S rDNA序列,结合GenBank中已报导的介形类18S rDNA序列,对介形纲4目9亚目中15超科的12个超科及其他具有代表性的“泛甲壳动物”共140个物种进行了系统发育关系分析。研究发现18S rDNA序列可能不适于解决介形类动物中亚纲以上阶元间的系统学问题,但在目和超科阶元水平的系统学研究可发挥重要作用。从介形类系统分类角度分析,研究结果：(1)支持传统分类系统中对壮肢亚纲的规划,即该亚纲下属两个目,其中吸海萤目(Halocyprida)包括肢足亚目(Cladocopina)和吸海萤亚目(Halocypridinae),壮肢目(Myodocopida)包括海萤超科(Cypridinoidea)、帚海萤超科(Sarsielloidea)以及圆壳海萤超科(Cylindroleberididae); (2)支持尾肢亚纲为单系群,但建议将传统分类系统中简肢目(Platycopida)中的小花介科(Cytherellidae)归于尾肢目(Podocopida),这样简肢目仅包括穿孔介科(Punciidae)一个类群,尾肢目内部形成((((巴氏介Bairdiocopina+达尔文介Darwinulocopina)+小花介Cytherellocopina)+金星介Cypridocopina)+浪花介Cytherocopina)的系统发育关系,尾肢目中最大的类群金星介亚目3个超科间的亲缘关系为((大介超科Macrocypridoidea+海星介超科Pontocypridoidea)+金星介亚目Cypridocopina)。