仔猪多胺代谢相关基因的克隆与表达分析

来源 :河南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:strong_zht
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为了研究多胺代谢相关基因在仔猪机体内的作用,本文以断乳前后仔猪为研究对象,依据报道的人、小鼠和大鼠的相似基因序列对猪的ESTs库和UniGene进行搜索并拼接序列设计引物进行RT-PCR,在猪体内克隆了以下七种与多胺代谢相关的基因:精氨酸脱羧酶(Arginine decarboxylase,ADC);鸟氨酸脱羧酶(Ornithine decarboxylase,ODC);鸟氨酸转氨酶(Ornithine aminotransferase,OAT);鸟氨酸脱羧酶抗酶蛋白-1(Ornithine decarboxylase antizyme 1, OAZ1);鸟氨酸脱羧酶抗酶蛋白-2(Ornithine decarboxylase antizyme 2, OAZ2);鸟氨酸脱羧酶抗酶蛋白-3(Ornithine decarboxylase antizyme 3, OAZ3);多胺调控因子-1(Polyamine-modulated factor 1,PMF1)。测定了这7种基因的序列,并分别与人、小鼠和大鼠的相关基因进行了同源性分析。试验采用半定量RT-PCR法,以18S rRNA为内标,研究仔猪于断乳前后各组织中这些多胺代谢相关基因mRNA表达水平。主要结果如下:猪精氨酸脱羧酶基因:克隆的猪ADC基因片段长1602 bp,包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),全长1380 bp,推测蛋白编码由460个氨基酸残基组成。猪ADC基因与人、小鼠的同源性分别为91.1%和87.4%,推测的氨基酸序列同源性分别为89.7%和87%。半定量分析显示,在断乳前后ADC mRNA在机体内的表达量均很低,部分组织几乎检测不到;断乳后,盲肠和直肠的表达量有所上升,其它各组织都有所下降。猪鸟氨酸脱羧酶基因:克隆的猪ODC基因片段长1422 bp,包含一个完整的ORF,全长为1383 bp,推测蛋白编码由461个氨基酸残基组成。猪ODC基因与人、小鼠和大鼠的同源性分别为86.1%、84.8%和84.4%,推测的氨基酸序列同源性分别为93.1%、89.8%和90.5%。半定量分析显示,在断乳前后ODC mRNA在机体各组织都有分布,但含量都不高;断乳后,盲肠和直肠的表达量有很大上升,空肠、回肠和结肠的表达量都有小幅下降。猪鸟氨酸转氨酶基因:克隆的猪OAT基因片段长1465 bp,包含一个完整的ORF,全长为1317 bp,推测蛋白编码由439个氨基酸残基组成。猪OAT基因与人、小鼠和大鼠的同源性分别为87.1%、82.2%和82.2%,推测的氨基酸序列同源性分别为91.8%、90.5%和89.8%。半定量分析显示,在断乳前后OAT mRNA在机体各组织广泛存在;断乳后,肾的表达量有明显上升,十二指肠、空肠和回肠都有所下降。猪鸟氨酸脱羧酶抗酶蛋白-1基因:克隆的猪OAZ1基因片段长874 bp,包含一个完整的ORF,全长为681 bp,推测蛋白编码由227个氨基酸残基组成,序列分析显示该基因存在移框机制。猪OAZ1基因与人、小鼠和大鼠的同源性分别为92.5%、85.1%和84.3%,推测的氨基酸序列同源性分别为93.4%、83.8%和82.5%。半定量分析显示,在断乳前后OAZ1 mRNA在机体内都有广泛而丰富的表达;断乳后,除了胃,其它组织表达水平均有所提高。猪鸟氨酸脱羧酶抗酶蛋白-2基因:克隆的猪OAZ2基因片段长678 bp,包含一个完整的ORF,全长为568 bp,推测蛋白编码由189个氨基酸残基组成,序列分析显示该基因存在移框机制。猪OAZ2基因与人、小鼠和大鼠的同源性分别为98.1%、97.9%和97.2%,推测的氨基酸序列同源性分别为99.5%、98.9%和98.9%。半定量分析显示,在断乳前后OAZ2 mRNA在机体内都有广泛而丰富的表达;断乳后,所有组织的表达量都有不同程度上升,尤以盲肠上升幅度最大。猪鸟氨酸脱羧酶抗酶蛋白-3基因:克隆的猪OAZ3基因片段长667 bp,包含一个完整的ORF,全长为559 bp,推测蛋白编码由186个氨基酸残基组成,序列分析显示该基因存在移框机制。猪OAZ3基因与人、小鼠和大鼠的同源性分别为89.6%、85.5%和84.8%,推测的氨基酸序列同源性分别为90.4%、87.5%和84.2%。半定量分析显示,在断乳前后OAZ3 mRNA在机体内广泛分布,个别组织表达量低;其在肠道组织的表达量于断乳后均有不同幅度上升。猪多胺调控因子-1基因:克隆的猪PMF1基因片段长703 bp,包含一个完整的ORF,全长为615 bp,推测蛋白编码由205个氨基酸残基组成。猪PMF1基因与人和小鼠的同源性分别为86.9%和76.6%,推测的氨基酸序列同源性分别为84%和70.9%。半定量分析显示,在断乳前后PMF1 mRNA在机体内广泛分布,个别组织表达量较低;断乳前,在空肠、回肠和结肠的表达量与抗酶家族大致相似,但在断乳后有小幅下降。
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