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曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)俗称墨鱼、血墨等,属头足纲(Cephalopoda)、十腕目(Decapoda)、乌贼科(Sepiidae),无针乌贼属(Sepiella)。本研究采用传统形态学分析方法以及线粒体DNA和微卫星标记,对5个曼氏无针乌贼放流群体以及2个曼氏无针乌贼野生群体的的遗传结构及遗传多样性现状进行了比较分析。其中放流群体来自舟山市西轩岛自行繁育的后代,野生群体为舟山近海捕获。形态学研究:对2个野生曼氏无针乌贼群体与5个放流曼氏无针乌贼群体进行全长、胴长、胴宽、体高、眼间距、眼径、头长、壳长、壳宽、胴长/胴宽10个指标测定、统计分析。结果显示,两个野生群体(YS1、YS2)与5个放流群体(F、F1、F2、F3、F4)在海螵蛸壳长、壳宽、全长、头长、胴长/胴宽5个形态学指标上存在显著差异,这表明野生群体与放流群体在形态上存在一定差异;5个连续世代的放流群体间形态上差异较小。微卫星引物筛选:采用高通量测序技术对曼氏无针乌贼转录组中的微卫星位点进行开发,总共开发出25个具多态性位点,这些位点等位基因数(N_A)在2—8不等,观测杂合度(Ho)值在0.083到0.922之间,期望杂合度(He)值在0.042到0.866之间,多态信息含量(PIC)在0.04到0.829之间。微卫星分析:采用6个微卫星位点标记对2个野生曼氏无针乌贼群体与5个放流曼氏无针乌贼群体的遗传多样性进行研究。结果显示,平均等位基因最低的为F3群体,其值为6.167,最高为YS1,其值为11;平均观测杂合度低的为F3,其值为0.396,最高的为YS1,其值为0.535;平均期望杂合度最低的为F3位点,其值为0.657,最高的为YS1,其值为0.779;平均多态信息含量最低的为F3,其值为0.588,最高的为YS1,其值为0.737;平均Shannon指数最低的为F2,为1.401,最高的为F3,其值为1.869。2个野生曼氏无针乌贼遗传多样性水平比5个放流曼氏无针乌贼群体稍高。线粒体DNA序列分析:采用线粒体COI基因对2个野生曼氏无针乌贼群体与5个放流曼氏无针乌贼群体的遗传多样性进行研究。结果显示,在单倍型多样度(Hd)、核苷酸多样度(π)上,两个野生群体(YS1、YS2)比5个放流群体(F、F1、F2、F3、F4)稍高。在F1中加入野生个体与部分F个体繁殖的后代,其后代F2的单倍型多样度、核苷酸多样度有所提高,本结果与微卫星标记结果相似,这也说明了加入外群对放流群体遗传多样性的保存有积极的作用。NJ系统发育树显示各单倍型间无明显分支,且单倍型H2大量存在于7个群体之间,本文推测单倍型H2主要来源于放流群体,因此大量存在于自然海域中。