湖北恩施马铃薯病毒病发生情况调查及分子鉴定

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恩施马铃薯产业在湖北省农业生产上占据着重要地位,但病毒病严重阻碍了当地马铃薯产业的发展。为了了解恩施地区主要马铃薯病毒病流行情况,本研究以恩施不同海拔和区域的118个取样点收集的442份农户自留种薯为材料,通过酶联免疫吸附法和二代测序技术检测了样品中的主要马铃薯病毒病,并利用反转录聚合酶链式反应技术进一步分析了相关病毒株系的多样性,为恩施地区马铃薯引种、育种和病毒病防治提供依据。主要研究结果如下:1.恩施州收集的农户自留种中PVS和PVM的ELISA检出率分别达53.5%和23.0%,是主要流行的马铃薯病毒。而PVA、PVX、PLRV和PVY四种病毒的检出率均低于10.0%。此外,还通过测序和RT-PCR检测到少量携带PVH和PMTV的样品。PVY在低山地区检出频率较二高山和高山地区更高,PVX在二高山地区发生频率最高,而PVS和PVM两种病毒则在高山地区更为常见。此外海拔1200米以上,PVY、PVX、PLRV和PVA病毒的检出率明显低于1200米以下,而PVM和PVS则在1200米以上发生频率更高。以区域划分,巴东和建始地区的样品受PVS和PVM侵染最为严重,而PVX和PVA在鹤峰地区较为流行。2.利用报道的基于RT-PCR的方法分析了PVS和PVY株系的多样性。结果显示,在113份PVS阳性样品中分别检测出59.3%的PVSO株系和29.2%的PVSA株系,以及少量这两个PVS株系的混合侵染。在23份PVY阳性样品中检测出60.8%的PVYNTN株系21.7%的PVYN:O株系和8.7%的PVYN株系。表明PVSO和PVYNTN分别是恩施PVS和PVY的主要流行株系。3.建立了基于RT-PCR的PVM和PVA株系分型方法,对恩施带毒样品进行了分析。结果显示,70份PVM阳性样品中,70.0%均为PVMO株系,同时也检测到少量PVMK、PVMT和PVMD1株系,但它们均与PVMO株系发生混合侵染。;在36份PVA阳性样品中,以PVAA和PVAW双株系混合侵染为主,其次是PVAA、PVAW和PVAT三株系的混合侵染,占比依次为61.1%和33.3%。
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