北柴胡是一种重要的药用植物,具有疏散退热、疏肝解郁、升举阳气的功效,在中国和其他亚洲国家已经使用数千年。北柴胡的市场需求量大,但野生柴胡资源有限,因此栽培北柴胡是药材市场的主要来源。栽培北柴胡对环境因子,尤其是土壤类型、种植模式、管理模式等非常敏感。在农业生产中,施肥种类及种植模式可直接影响北柴胡产量、品质和土壤生态。但种植模式和施肥模式对北柴胡的土壤微生态的影响尚未见报道。目的:研究不同施肥模式对北柴胡的生长、产量、品质、微生物反应的影响以及种植模式对北柴胡根际微生态的影响。方法:采集不同施肥模式和种植模式下北柴胡的根际土壤。首先基于HPLC技术检测柴胡皂苷a、c、d的含量;其次分析根际土壤理化性质和酶活性;此外,基于高通量测序技术分析北柴胡根际土壤微生物多样性、组成及功能。结果:和对照相比,哈茨木霉生物菌肥不仅提高了北柴胡茎长、茎粗、根粗等性状参数和北柴胡的产量,同时还显著提高了柴胡皂苷a、c和d的含量。此外,哈茨木霉哈茨木霉生物菌肥还提高土壤养分NH4+-N、NO3--N、Ava-P和Ava-K的含量以及土壤蔗糖酶和过氧化氢酶的活性。不同施肥模式下,施用哈茨木霉生物菌肥改变了北柴胡根际微生物多样性和群落结构。在属水平上,根际土壤中有益菌属（链霉菌属、根瘤菌属、类固醇杆菌属等）的相对丰度升高,病原菌属（赤霉菌属、异茎点霉属、镰刀菌属等）的相对丰度降低。通过比较不同种植模式下北柴胡根际土壤化学性质发现,北柴胡连作后pH、NO3--N和Ava-K含量降低,间作和玉米轮作后pH、NO3--N和Ava-K含量升高。土壤SOM和NH4+-N在连作和间作后呈下降趋势,轮作后呈上升趋势。不同种植模式还改变北柴胡微生物群落多样性和结构。我们还发现北柴胡连作降低有益微生物（毛壳菌属、被孢霉属、光黑壳属等）的相对丰度,升高有害菌（链格孢属、异茎点霉属、炭疽菌属等）的相对丰度,从而增加土壤传播疾病的风险。结论:哈茨木霉生物菌肥不仅促进北柴胡生长,改善北柴胡的品质,还改变北柴胡根际微生态。间作和轮作可以缓解北柴胡连作障碍。因此,施用哈茨木霉生物肥和调整北柴胡与玉米间作或轮作等栽培模式可以保持根际微生物的菌落结构稳定,促进北柴胡种植业的健康发展。