国外学者研究均发现家族终极控股股东大多都通过金字塔结构等方式获取比其现金流权要大的控制权，造成了新的“两权分离”，加剧了家族企业的代理成本，严重影响着家族企业价值，同时国外学者还引入了外部的制度环境因素，发现好的制度环境有利于抑制两权分离对企业价值的负面影响。随着改革开放的深入，在中国特色的社会制度和经济环境下，我国家族企业也日益壮大。我国家族企业两权分离情况是怎样的，这种分离对家族企业价值有着怎样的影响？我国的制度环境能否保护中小股东的利益，保障家族企业价值的提升呢？本文以我国2006-2009年家族上市公司为样本，基于股权分置改革的时代背景，分别通过规范和实证的方法，结合公司治理的相关理论，分析了家族上市公司两权分离、制度环境对企业价值的影响，同时进一步检验了制度环境对两权分离与公司价值关系的影响作用。研究结论显示，家族上市公司两权分离度与企业价值呈负相关关系，制度环境则与企业价值呈正相关关系，制度环境的改善，有利于减轻家族终极控股股东两权分离对企业价值的负向影响。此外，独立董事的比例与公司价值的关系不显著或显著性水平较低，独立董事并没有发挥其应有的监督作用。因此，本文提出了优化股权结构，健全中小股东保护的制度体系，完善家族上市公司信息披露制度，加强对家族终极控制人的监督，建立中小股东民事赔偿制度以及鼓励家族企业整体上市等政策建议。这对于完善家族企业的公司治理，加强中小股东的保护具有重要的理论和现实意义。