桑树盐胁迫相关基因的克隆及功能分析

来源 :江苏科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:KenBlove
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
土壤盐渍化是危害农业生产最具限制性和破坏性的因素,盐胁迫主要导致植物膜损伤、光合抑制、营养失衡和代谢紊乱等,阻碍植物生长发育。在盐碱化土壤中种植具有耐盐性、经济价值和观赏价值的植物,既能有效利用土地资源,又能改善生态环境。桑树具有耐盐、抗旱、发根力强、生长迅速等特点,在养蚕、生态、医药等方面有多种用途,具有十分强大的经济效益和社会效益。本文分析了桑树在盐胁迫下的生理生化指标、光合特性以及转录组测序等数据,并对耐盐关键基因进行克隆及功能鉴定。研究结果为挖掘桑树耐盐关键响应基因,筛选桑树耐盐单株提供重要的分子依据,有利于桑树耐盐品种的筛选和推广应用。主要研究结果如下:1.桑树盐胁迫生理生化及光合特性分析:桑树盐胁迫生理生化指标测定发现盐处理后其丙二醛(Malondialdehyde,MDA)、可溶性蛋白(Soluble protein)含量均明显升高,且叶片脯氨酸(Proline,PRO)、超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)、过氧化物酶(Peroxidase,POD)活性增强,结果证明桑树幼苗在盐胁迫下通过调节抗氧化酶活性来控制MDA和H2O2的氧化损伤从而对盐害环境作出反馈机制。桑苗经高浓度Na Cl处理后,其净光合速率(A)、气孔导度(gs)、蒸腾速率(E)以及水分利用效率(WUE)均会降低,同时胞间CO2浓度(Ci)出现波动变化。表明盐胁迫会对桑树叶片的光合特性指标产生较大影响,盐胁迫下土壤中高浓度的盐分离子以及植物中Na+的积累会对植物造成离子胁迫和渗透胁迫,破坏桑树叶片的水分吸收和叶绿素合成,抑制光合作用。Na Cl溶液处理后24h内桑树叶片气孔开放程度随胁迫时间增加逐渐减小直至关闭,叶片气孔开度减小,会阻碍叶片的水分蒸腾作用,导致桑树光合所需CO2无法大量通过气孔进入叶片,造成桑叶光合速率降低。2.桑树盐胁迫转录组分析:将桑树叶片和疏导组织样品进行转录组测序。桑叶转录组各样品平均产出6.24Gb数据,20,867个基因数可检测表达,19,826个为已知基因,1,041个为预测新基因,共检测出11,857个新转录本。通过数据过滤、参考基因组比对、差异基因分析,CK-SY VS SY-1、CK-SY VS SY-3、CK-SY VS SY-5和CK-SY VS SY-7四个组别中的差异表达基因数目分别是236、1421、1678和5334。疏导组织转录组各样品平均产出6.42 Gb数据,20,497个基因数可检测表达,19,561个为已知基因,936个预测新基因,共检测出9,447个新转录本,四个组别中差异基因数分别是241、444、1757和3853。两个转录组数据对比分析显示,GO注释中差异表达基因主要参与细胞、代谢过程、细胞器组装、膜结构、催化活性等过程。KEGG Pathway富集发现类黄酮生物合成、淀粉和蔗糖代谢、植物丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、植物激素信号转导等途径与桑树盐胁迫有关,其中,MAPK信号通路和植物激素信号通路中差异表达基因数量最大。3.桑树Mm WRKY33基因的克隆、表达及功能鉴定:桑树中克隆得到Mm WRKY33基因(Gen Bank:ON437586),cds序列1656 bp,编码551个氨基酸的蛋白质,预测蛋白质分子大小为61.1KD,等电点大小为4.71,属于WRKY转录因子家族。利用生信软件对其三级结构进行预测,并分析与其他植物物种的同源性及亲缘关系。q PCR检测发现桑树受到盐胁迫时Mm WRKY33及下游基因CYP94B1的表达水平提高。VIGS技术成功沉默Mm WRKY33基因的靶标片段,实验组桑叶样品中Mm WRKY33和CYP94B1表达水平较空白和空载两个对照组显著下降,推测桑树中MAPK信号通路中的Mm WRKY33及其下游基因CYP94B1是桑树盐胁迫条件下的的正向调控因子。4.桑树Mm EIL1基因的克隆、表达及功能鉴定:桑树中克隆得到Mm EIL1基因(Gen Bank:ON437587),cds序列1842 bp,编码613个氨基酸的蛋白质,预测蛋白质分子大小为69.72 k D,等电点大小为5.96,属于EIN3转录因子家族,是乙烯信号转导途径中的转录因子,正向调控ERF1基因,提高植物耐盐性。利用生信软件对其三级结构进行预测,并分析与其他植物物种的同源性及亲缘关系。q PCR检测发现桑树盐处理下Mm EIL1及其下游基因ERF1B表达量增加。VIGS技术瞬时沉默Mm EIL1基因后,实验组桑叶样品中Mm EIL1和ERF1B表达水平较CK明显降低,推测乙烯信号通路中的Mm EIL1及其下游基因ERF1B均参与桑树盐胁迫反应。
其他文献
<正>新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)(简称“新冠肺炎”)在全世界的传播和蔓延给民众,特别是老年人的身心健康带来了巨大影响,约80%感染新冠肺炎的患者存在一个或多个长期的症状[1~3](Ⅰ级证据).世界卫生组织(World Health Organization, WHO)将这种长期症状持续至少2个月以上的定义为长病程新冠肺炎(long CO
期刊
情感分析技术的主要目的是对评论文本进行正负向的情感分类,这对人们的生活有重要的作用。近年来,随着神经网络的兴起,利用深度学习解决情感分析问题成为了一种趋势,它具有多变的学习结构,能够充分挖掘提取文本信息的抽象特征,本文就是基于深度学习的基础上进行情感分析。针对卷积神经网络(CNN)只能提取文本的局部信息和循环神经网络(RNN)容易陷入梯度爆炸的问题,设计了一种将CNN与双层双向门控循环单元(BIG
学位
<正>从上市银行2022年年报看,各家银行在个人养老金元年都交出了一份可圈可点的成绩单,虽有不足但已渐入佳境。随着个人养老金业务的全面启航,银行业金融机构开始全方位参与三大支柱养老保险体系的建设,养老理财、养老储蓄等养老金融产品也正式开启新一轮竞争。个人养老金元年首份成绩单2022年可谓是个人养老金推出的元年。
期刊
<正>美国银行系资管机构在养老财富管理领域发展较早,依托于美国成熟的养老三支柱体系和庞大的养老金市场,众多银行系资管机构积累了丰富的养老财富管理运营经验。研究美国银行系资管机构发展养老财富管理业务的逻辑,梳理其养老财富管理运营经验,对于我国商业银行优化养老财富管理业务发展路径意义重大。
期刊
随着物联网技术的发展,如何为大量的物联网设备供能成为了当今物联网领域急需解决的关键问题。无源物联网系统通过从环境中采集能量,具有体积小、寿命长、免维护的优势,为物联网的发展提供了巨大的机遇。但是也有一些新的问题和挑战存在,其中能量匮乏是无源物联网系统的核心问题:(1)现有的无源物联网系统虽然能从环境中采集能量,但是单一的环境能量源存在着许多局限性,稳定性较低,从而导致无源物联网系统获取能量的效率较
学位
随着互联网与社交媒体的迅猛发展,网民规模、网络覆盖范围及网络使用频率等与日俱增,这为突发事件在网络中的短时间、大范围传播提供了客观条件。同时,社交媒体平台的匿名化、多样性、开放性等属性,使公众角色发生转换。但是,平台的匿名化促使网民群体更复杂,而媒体的抢快追新等特性使得新闻报道失真等,舆情反转时有发生。舆情反转既消耗民众感情,刺激民众负面情绪的滋生,影响民众对主流媒体及政府相关部门处理突发事件能力
学位
随着海洋建设的深入,单个自主水下航行器(Autonomous Underwater Vehicles,AUV)越来越难以满足任务的实际需求。在综合考虑质量和成本等因素后,多AUV集群协同作业模式受到广泛的关注和发展。高精度的导航系统是多AUV协同作业高效且有用作业的前提,由于水下环境的复杂性以及传感器性能参数的限制性,会出现系统噪声统计特性不准确或噪声统计特性发生改变等问题,进而对AUV定位精度产
学位
文章回顾了2022年广东省造纸工业的发展情况,并对未来的形势进行了分析与展望。
期刊
派屈克·韩南(Patrick Hanan)是美国知名汉学家,曾任哈佛燕京学社第五任社长,被誉为“欧美明清小说研究第一人”。他将晚清小说的兴起视为中国现代小说的先声,旨在挖掘其在中国文学史中不应被湮没的历史价值。其中一部《风月梦》具有浓厚的扬州风土气息,呈现出彼时扬州真实的城市风貌,被韩南誉为“中国第一部城市小说”。本文以韩南英译《风月梦》为例,探讨他在翻译中如何使用第三人称代词,以及通过《风月梦》
学位
<正>随着我国人口老龄化速度加快、平均预期寿命延长、老年人口抚养比攀升以及“退休潮”的来临,积极应对人口老龄化已上升为国家战略。商业银行作为金融机构的主体,在居民养老财富管理服务方面发挥着至关重要的作用。
期刊