农业属于第一产业，是国民经济的基础产业。良好的农业基础设施是农业发展的重要条件。改革开放以来，我国的基础设施投资建设重点多集中于二、三产业，对农业基础设施的投资有所欠缺。有些省份的农业基础设施一直得不到更新。农业基础设施建设方面的不足，不仅阻碍了我国农业生产能力的提高同时也降低了我国农业生产抵御农业灾害的能力。从2000年开始，政府对农业关注程度一直在增加，也加大了对农业基础设施的投资力度。为了更全面地了解投资效果，本文运用数据包络分析法对各省农业基础设施投资效率进行分析评价。本文首先在回顾基础设施概念的发展历程的基础上，对农业基础设施概念进行回顾。然后结合实际情况对农业基础设施体的进行了界定，把本文所论述的农业基础体系限定在三个方面——水利建设（包括了防洪、灌溉、除涝、水土保持等）、农村公路、农村电力。在确定了农业基础设施体系的概念基础上，本文结合农业基础设施体系的性质把农业基础设施投资所促进农业全要素生产率的增长作为数据包络分析（DEA）模型的产出指标。把水利建设、农村公路、农村电力方面的投入作为DEA模型的投入指标。为了排除环境因素对农业基础设施投资效率的干扰，本文采用三阶段DEA模型。最后在实证分析的基础上得出结论：我国各省的农业基础设施投资效率差距在逐渐缩小。我国农业生产受天气因素的制约很强，农业生产极易受农业灾害的影响，抵御农业灾害的能力很不足。此外经济落后地区的在更新农业基础设施方面受自身财力制约，需要中央政府进一步倾斜照顾。就农业基础设施存量上而言，各省分布也不均匀。最后在实证分析的基础上，提出提高农业基础设施投资的效率的政策性建议。