高校学科建设评价研究的目的是不断提升高校学科管理水平,学科建设评价研究方法的不断创新和选用模型的是否贴合高校学科建设发展的现实情况会影响研究结果的有效性，这对促进学科的发展和提升高校学科建设的管理水平显得尤为重要。本文采用重庆高校“十一五”市级重点学科建设的统计数据，选用生态位适宜度理论和模型对重庆高校市级重点学科148个学科进行生态位适宜度测算分析。主要研究结果如下：1、依据生态学理论，高校的学科是一个层次和类型纵横交错且错落有致的生态系统，整个系统是否和谐、协调不仅关乎学科科研和学术队伍等方面的适宜程度，而且关乎整个高校的核心能力和学科的可持续发展能力。因此，将生态位适宜度理论和模型引入学科建设评价中理论上是可行的。2、学科的生态位适宜度是指一个学科的现实生态位与其最佳生态位之间的贴近程度，具体表现为该学科对其生境条件的适宜程度，选用生态位适宜度模型测算学科的生态位适宜度。3、构建生态位适宜度研究的指标体系，建立的指标体系一共分为2个一级指标、4个二级指标及31个三级指标。本文前期系统整理了重庆17所高校“十一五”市级重点学科相关数据，包含36个市级重点一级学科，111个市级重点二级学科，参考已有文献，选用生态位适宜度模型，对本文所采用的数据做了归一化处理。4、参考已有文献，选取生态位适宜度模型，本文先后测算了重庆高校自然科学、人文社会科学市级重点学科一级学科、二级学科的生态位适宜度。结果表明，不同学科的生态位适宜度差异明显，说明不同学科对其生境条件的适宜程度有较大的不同。因此，本文将生态位适宜度理论对重庆高校进行学科评价具有使用价值。5、依据本文研究结果，从生态学角度对重庆高校学科建设提出了建议和对策。