随着我国经济市场化程度不断加深,金融业在经济发展中发挥的作用日益重要。目前,我国融资结构仍以商业银行的间接融资为主,因而,商业银行在经济社会资本配置中起着举足轻重的作用。因此,通过对商业银行的效率进行评估,不仅可以了解我国商业银行的经营现状,而且可以了解商业银行的相对无效率究竟来自其生产经营的哪个阶段,从而可以提出有针对性的改进措施。本文以我国2011年—2013年16家上市银行为研究对象,使用两阶段DEA方法来评估上述银行的整体效率,并把整体效率分为经营效率和市场效率两部分,并使用超效率的方法对有效率的商业银行做进一步的效率评价。得出的相对效率值有助于了解商业银行效率的现状,实证结果发现经营效率与市场效率的相关性不强,四大银行的总效率高于其他12家商业银行,而总效率的差异是主要是由市场效率的差异引起的。要提高商业银行的效率,必须要加强商业银行的成本控制,最优化使用资源,不断提高资源的内在价值,加强银行业全面风险管理。