ATP特异性适配体的筛选和应用

来源 :江南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:superzergking
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
腺嘌呤核苷三磷酸(ATP)是生物体的主要能量来源,在各种微生物代谢过程中起重要调控作用,同时,体内ATP浓度的异常波动往往与一些疾病的产生有关,因此构建高灵敏的ATP检测方法在发酵工程以及医学研究等领域具有重要意义。适配体因亲和力高、特异性强等优点被广泛应用于检测领域。然而,目前常用的ATP适配体不能区分ATP、ADP与AMP,这对ATP的检测造成了巨大的干扰。本文利用指数富集的配体系统进化技术(systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX),经过逐轮筛选,获得了ATP特异性DNA适配体,对适配体进行序列优化后,得到一条能明显区分ATP、ADP与AMP的最优适配体,并利用最优适配体成功构建了检测ATP的生物传感器。具体研究结果如下:本研究利用固定双链DNA文库的磁珠SELEX技术,从79 nt的初始单链DNA文库中筛选获得ATP特异性适配体。经过多轮正筛选和反筛选后,将最终筛选产物进行高通量测序。随后,对测序结果进行分析并将挑选出的47条序列分为7个家族。根据二级结构稳定性从不同家族中挑选5条序列并分别验证其性能。结果表明,ap 1的亲和力和特异性均最高,其解离常数(Kd)值为81.66±10.52 nmol·L-1。根据二级结构模拟及分子对接结果对ap 1进行截短优化,通过除去非必要核苷酸得到长度仅为32 nt的适配体ap 1-1。经测定,ap 1-1的Kd值为70.61±20.91 nmol·L-1,较截短前有所降低,且仍保留对ATP的特异性。基于最优适配体ap 1-1构建了ATP荧光生物传感器,该传感器将氧化石墨烯(GO)与链置换扩增反应相结合,将ATP浓度的测定转化为荧光信号的测定。经原理验证,该传感器是可行的,随后对检测过程中的几个关键因素进行优化。在最优检测条件下,当ATP浓度在0.1μmol·L-1至25μmol·L-1之间时,荧光强度与ATP浓度呈较好的线性关系,检测限为33.85 nmol·L-1。经测定,该传感器表现出较强的特异性,更重要的是其能明显区分ATP、ADP与AMP,克服了目前ATP适配体传感器的特异性不足。最后,通过对人血清样品中ATP的检测,该传感器表现出良好的实际应用潜力。本研究获得的ATP特异性适配体及构建的荧光适配体生物传感器可实现ATP的高灵敏及高特异性检测,对机体内ATP浓度的准确评估具有重要意义。
其他文献
在“双碳”目标的驱动下,以光伏和风力发电为代表的新能源发电系统由于其绿色环保的特点,将会得到持续大力的发展。并网逆变器作为其直流侧和交流侧之间的桥梁,保证其可靠运行至关重要。其中,LCL型并网逆变器因其出色的开关谐波抑制能力而得到了广泛的应用,本文对其在非理想电网条件以及多机并联运行工况下的谐振问题进行了相关研究,并且在不增加额外硬件的前提条件下,通过对数字控制算法的改进,提出了相应的宽频谐振抑制
学位
星地融合网络能够有效扩展地面网络覆盖范围,为实现“万物互联”提供有力支撑,是目前移动通信领域的研究热点。然而,由于阴影效应的影响,卫星与地面用户之间的直达链路可能处于深度衰落,因此亟需提高通信可靠性;由于卫星回程链路长,降低数据传输时延尤为重要;由于频谱资源不可再生,如何提升频谱利用率受到学术界广泛关注。针对以上问题,本文基于星地融合网络,利用中继技术增强信号接收,采用缓存技术降低通信时延,通过非
学位
镁基纤维金属层合板(Mg-FMLs)是一种由镁合金和纤维增强聚合物复合材料层铺堆叠而成的新型轻质结构材料,在汽车、航空工业、船舶和国防军工等领域具有较大的应用前景。镁合金与纤维复合材料的界面性能决定了镁基纤维层合板的综合力学性能。表面改性处理是改善金属纤维层合板界面结合强度的主要方法,但目前应用于镁基纤维金属层合板表面处理的方法存在一定的缺陷。基于FMLs的界面强化理论,本工作致力于探寻高效率、低
学位
中国白酒酿造是一个在开放环境下由多种来源的微生物群落共同驱动的谷物发酵过程,其中核心的细菌和真菌已经受到了相当多的关注,被认为是影响发酵产物和品质的关键因素。除此之外,近年来食品发酵中感染微生物的病毒也逐渐开始被研究。病毒是没有细胞结构的生命实体,可以感染包括微生物在内的所有细胞生命形式。以微生物作为宿主的病毒可以调节群落结构且具有改变宿主代谢的潜力。因此,探索在白酒发酵过程中尚未被研究的微生物病
学位
聚烯烃(polyethylene(PE),polypropylene(PP)和polystyrene(PS)等)作为性能优越,价格低廉的材料,在日常生活中的使用量越来越大,其废弃物总量也大幅增加。相比化学机械降解塑料,生物降解聚烯烃更安全无毒。生物降解聚烯烃的研究近年来主要集中在一些微生物和食用塑料的昆虫上,如Penicillium simplicissimum、黄粉虫、蜡螟等;还有部分酶,如漆酶
学位
熊蜂生假丝酵母(Starmerella bombicola,S.bombicola)作为一种非常规酵母,具有利用油脂且耐糖耐酸的性能,以及高效生产槐糖脂的能力,工业应用潜力大。由于遗传背景不清晰且缺乏高效的遗传改造技术,导致系统代谢工程改造受到阻碍。发展高效的基因编辑技术能够为S.bombicola的代谢改造提供坚实的技术支撑。本研究首次在S.bombicola中构建了CRISPR-Cas12a基
学位
禽肉加工业的蓬勃发展导致全世界范围内每年产生约几百万吨羽毛废弃物,废弃物的处理成为亟待解决的问题。相较于物理和化学处理方法伴随的高能耗、高污染等弊端,生物法降解羽毛具有环境友好、能耗低和水解产物营养价值高等优点。角蛋白酶可以特异性地降解角蛋白,但是需要与还原剂协同作用才能实现对羽毛的高效降解,而二硫苏糖醇(DTT)、β-巯基乙醇和亚硫酸盐等还原剂通常具有毒性或导致水解产物盐分过高。天然的羽毛降解菌
学位
过敏性哮喘是一种发病机制不明确,且具有异质性的慢性病。过敏性哮喘以免疫球蛋白E(Immunoglobulin E,Ig E)的异常升高为主要特征。CD4+T细胞免疫失调与过敏性哮喘的病理过程密切相关。滤泡调节性T细胞(follicular regulatory T cell,TFR)是一类新发现的在生发中心具有负向调控功能的CD4+T细胞亚群,在系统性红斑狼疮、干燥症和过敏性鼻炎等疾病中发挥重要调
学位
在工业发酵中,微生物菌株常面临氧化胁迫、温度、pH、渗透压、营养饥饿等环境压力,尤其在发酵中后期活性氧非常不利于菌株保持良好的生理性状和工业生产性能。钝齿棒杆菌(Corynebacterium crenatum)SYPA5-5在高溶氧发酵条件下生产L-精氨酸会产生大量的ROS,显著影响其细胞生长和目标产物的代谢合成效率。本研究以钝齿棒杆菌SigE(RNA polymerase sigma fact
学位
采用绝迹稀释法对长庆油田某作业区采出水中微生物进行生长监测和相关杀菌剂的筛选。研究发现,该作业区大部分区块的井下微生物繁殖情况严重,是管道和设备腐蚀的主要原因之一。6种杀菌剂的室内评价表明:KEW-538B杀菌剂对SRB和TGB的效果最好(50 mg·L-1);PS-30对IB的杀菌效果最好(10 mg·L-1);每日单次加药的现场实验结果与室内评价结果基本相同。采用计量泵或每日多次(每天大于8次
期刊