农村问题目前仍然是国家的重点关注对象,农村问题最直观的反映是农村经济的繁荣与发展,农村经济的繁荣与发展体现在农村经济绩效的提升,作为农村经济中重要构成元素的农村集体经济组织,其健康有序的发展对助力乡村振兴具有重要意义。本研究主要就农村集体经济组织内部控制对其经济绩效的影响进行分析,探究提升农村集体经济组织经济绩效的方法与对策。在梳理了农村集体经济组织和内部控制相关文献后,运用描述性统计法分析了广州市白云区和海珠区农村集体经济组织2018年的相关经济绩效财务指标,基于委托代理理论和内部控制理论,提出研究假设,以广州市白云区和海珠区两个区的农村集体经济组织2018年的经济绩效和内部控制问卷调查结果为样本数据,以资产使用效率指标为被解释变量,以内部控制中的内部环境、风险评估、控制活动、信息沟通、内部监督等五要素作为自变量,以资产规模、资产负债率和集体经济组织所在地区的城镇化进程为控制变量。利用SPSS软件运用回归分析方法实证检验了农村集体经济组织内部控制与经济绩效的关系,丰富了内部控制的研究内容,为发展壮大农村集体经济提供参考。通过实证研究得出以下结论:农村集体经济组织的内部环境和控制活动与组织资产使用效率显著正相关,但是农村集体经济组织的风险评估、信息与沟通与组织资产使用效率显著负相关,内部监督活动与组织资产使用效率未通过显著性检验。研究结果表明当前农村集体经济组织内部控制虽然在一定程度上促进了组织经济绩效提升,但是内部控制仍不够科学、完善,仍然存在管理水平不高等许多问题,今后一个时期,完善内部控制建设仍应是农村集体经济组织的一项中心工作。