中小股东是促进我国资本市场健康稳定发展的重要基石,而上市公司大股东侵占中小股东权益的现象十分普遍,因此保护中小股东合法权益至关重要。机构投资者可以采取股东积极主义有效改善公司治理从而促进中小股东保护,然而同样追求超额回报的机构投资者也可能与控股股东相互串通,损害中小股东合法权益。那么,机构投资者是中小股东权益的保护者还是大股东的合谋者呢?因此,本文对机构投资者异质性与中小股东保护的关系进行研究,并检验外部法治环境和内部控制的调节作用,以期为机构投资者保护中小股东权益提供直接证据,拓展中小股东保护的相关研究,促进我国中小股东保护和资本市场持续健康发展。本文以A股上市公司的2011年-2020年投资者保护指数（AIPI）和2010年-2019年其他数据为样本,采用规范研究法和实证研究法进行研究。基于委托代理理论、信息不对称理论、掏空理论和股东积极主义进行分析,并通过描述性统计、相关性分析、Logit回归、Probit回归、IV Probit估计和两步法,对机构投资者及异质性与中小股东保护的关系,外部法治环境和内部控制的调节作用进行检验。本文研究发现:（1）总体上机构投资者持股有利于中小股东保护。（2）相比于非独立机构投资者和交易型机构投资者,独立机构投资者和稳定型机构投资者更有利于促进中小股东保护。（3）外部法治环境对机构投资者持股、机构投资者独立性与中小股东保护的关系具有正向调节作用,而对机构投资者稳定性与中小股东保护的关系没有调节作用。内部控制对机构投资者持股与中小股东保护的关系具有正向调节作用,对机构投资者独立性和稳定性的正向调节作用不显著。并且外部法治环境发挥的正向调节作用要明显强于内部控制。（4）在机构投资者地域异质性中,境外机构投资者持股比境内机构投资者持股更有利于促进中小股东保护。在机构投资者个体异质性中,证券投资基金、合格境外投资者和社保基金持股均可以促进中小股东保护,而券商、保险公司和信托投资公司持股对中小股东保护不产生促进作用。基于以上研究结论,本文从分类规范发展机构投资者、完善中小股东保护的社会法治建设、提高内部控制的设计效果和执行力度三个方面提出相关建议。