研究背景自新型冠状病毒肺炎（Corona Virus Disease 2019,COVID-19）爆发以来,截至2022年3月1日,全球累计确诊人数已超过4.3亿人,累计治愈人数已超过3.6亿人。COVID-19引起的病理生理变化可对身体产生长期影响并引发持续的症状。COVID-19患者最常见的症状为发热和咳嗽,其次是乏力、咳痰、气促、肌痛或关节疼痛、咽喉痛、头痛、寒战等。研究表明,COVID-19重症患者出院后3个月仍存在严重的肺功能损害的症状。对COVID-19患者进行6个月的随访发现,疲劳、睡眠障碍、感觉障碍、呼吸困难等症状还会频繁出现。因此,持续关注新冠肺炎康复者的健康状况,并尝试改善COVID-19引发的并发症和后遗症是有重要临床意义的。人类微生物组和代谢组的变化与多种疾病密切相关,在调节人体的代谢、免疫、消化吸收等方面发挥重要作用。COVID-19患者的肠道和口腔微生物组及血浆代谢组学发生了显著变化。但是,在一年的恢复后,它们的特征是否恢复正常尚不清楚。此外,微生物组和代谢谱之间的相关性以及它们如何影响COVID-19的康复也是未知的。目的本研究致力于描述COVID-19一年恢复期患者的口腔微生物组、肠道微生物组和血浆代谢组特征,鉴定在COVID-19恢复过程中的关键微生物和代谢物,并评估微生物和代谢物作为诊断和预后标志物的潜力。最后探索了微生物组和代谢谱之间的相关性。方法我们招募了 35名COVID-19确诊患者和160名健康对照者。COVID-19患者在治愈出院时和1年后随访时留下标本。我们共前瞻性地收集497份样本,其中舌苔样本219份,粪便样本129份,血浆样本149份。舌苔和粪便样本进行16SrRNAMesiq测序,血浆样本采用高效液相色谱-质谱进行非靶向代谢组学检测。结果与治愈出院时相比,康复者一年后的口腔和肠道菌群及血浆代谢组学特征均有较大程度的恢复,但并未完全恢复正常。在COVID-19的恢复过程中,口腔和肠道微生物组的多样性逐渐增加。其中产丁酸菌和益生菌逐渐增加,而产脂多糖的细菌逐渐减少。此外,血浆中PE（15:0/16:1（9Z））、色氨酸甜菜碱和邻苯二酚硫酸盐等代谢物的丰度逐渐增加,而（±）18-HEPE、Quinquenoside Fl、5（S）-HpETE等代谢物的丰度逐渐降低。同时,与COVID-19的炎症因子风暴密切相关的1-磷脂鞘氨醇（S1P）在恢复过程中逐渐增加。其次,基于确诊患者治愈出院时的口腔和肠道微生物及血浆代谢物建立的一年后中和抗体预测模型分别达到了 90.48%、85.71%和87.04%的预测效率。最后,COVID-19恢复过程中关键口腔和肠道微生物及血浆代谢物的Spearman相关性分析表明血浆中S1P的丰度与肠道中粪杆菌属、双歧杆菌属、毛螺菌属的丰度,和口腔中消化链球菌属和链球菌属的丰度呈正相关,与口腔中伯克霍尔德菌目的丰度呈负相关。结论本研究首次对COVID-19一年期康复者的口腔和肠道微生物组和血浆代谢组进行了表征,并鉴定了COVID-19恢复过程中的关键微生物和代谢物。此外,基于微生物和代谢物的预测模型为预测COVID-19康复者中和抗体水平提供了新工具。本研究为促进COVID-19康复提供了新靶点和新策略。