在十九届中央纪律检查委员会第四次全体会议中,中央已经明确指出行政事业单位要发挥内部控制审计监督的作用,推动行政事业单位形成内部控制审计监督全覆盖的局面。国家也在陆续不断地出台相关规范指导性文件与指引,诸如2009年出台的《内部审计实务指南第4号-高校内部审计》、2012年11月底发布的《行政事业单位内部控制规范（试行）》、2015年底财政部下发的《关于全面推进行政事业单位内部控制建设的指导意见》、2016年发布的《教育部直属高校经济活动内部控制指南（试行）》都为单位或者高校的内部控制审计工作提供了政策保障。基于以上背景可以看出,审计是基于法律法规且具有强制性和权威性的特点,它是审计人员站在客观立场,利用职业判断来判断内部控制存在哪些缺陷,最后给出审计建议,而评价作为审计过程中关键的一环,如何识别内部控制的建设和实施效果中的不足是至关重要的。以内部控制评价为手段来推进单位完成内部控制建设与实施工作已经成为审计监督全覆盖中关键的一环,因此本文对高校内部控制审计政策及指引进行梳理,从审计的要素和评价过程进行展开说明,主要是运用层次分析法构建高校内部控制审计评价指标并利用模糊综合评价进行综合分析,为将来对单位实施内控审计时可以提高审计效率,降低审计成本并给出客观结论。本论文首先采用了文献研究法,详细介绍了与高校内部控制审计有关的研究现状以及理论基础,并以上述文件作为构建高校内部控制审计设计的依据,进行了简要的整理,并详细分析了高校实施内控审计的理论、可行性、制度分析等,进而为高校内控审计框架的构建提供必要性以及合理性。选择了具有代表性的H高校作为案例应用对象,采用访谈与调研法,实地搜集了H高校内控审计的相关数据,结合H高校实际情况,对H高校的内部控制的建设与执行情况给予了审计评价。最后论文采用层次分析法从单位层面和业务层面在高校内控审计的具体应用中展开实际性探索并进行分析,从而得出本文的主要研究结论。