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目的：探讨IFITM1和HS3ST2基因启动子甲基化与新疆维吾尔族妇女宫颈癌的相关性以及早期诊断的可行性。分析IFITM1和HS3ST2基因启动子甲基化对mRNA表达的影响以及IFITM1蛋白在新疆维吾尔族妇女宫颈癌组织和正常宫颈组织中的表达水平。方法：采用甲基化特异性PCR方法和HPV16，HPV18特异的PCR方法分别检测了40例新疆维吾尔族妇女正常宫颈组织和40例宫颈癌组织的IFITM1基因启动子甲基化和HPV16，HPV18感染的情况，检测了40例正常宫颈组织，10例CIN1，10例CIN2，10例CIN3和40例新疆维吾尔族妇女宫颈癌组织的HS3ST2基因启动子甲基化和HPV16，HPV18的感染情况，并分别分析了基因启动子甲基化和HPV16，HPV18感染的相关性。用RT-PCR方法分别检测了10例IFITM1，HS3ST2基因启动子甲基化阳性和10例IFITM1，HS3ST2基因启动子甲基化阴性组织的IFITM1mRNA表达情况。通过免疫组化技术分析了IFITM1蛋白在35例新疆维吾尔族妇女正常宫颈组织和35例宫颈癌组织中的表达水平。结果：31例宫颈癌组织和3例正常组织发生了IFITM1基因启动子甲基化。37例宫颈癌组织，7例CIN3,和5例CIN2发生HS3ST2基因启动子甲基化，CIN1和正常组织没有发生HS3ST2基因启动子甲基化，相应的HPV16/18感染例数分别为27,5,3,1和5例.在40例宫颈癌组织中，HPV16/18感染阳性组织的IFITM1基因启动子甲基化发生率比HPV16/18感染阴性组织的发生率高，在60例CIN2以上的宫颈病变组织中，HS3ST2基因启动子甲基化发生率比阴性组织的发生率高(both P<0.05)。在10例IFITM1基因启动子甲基化阳性的宫颈组织中IFITM1基因mRNA的表达水平低于10例IFITM1基因启动子甲基化阴性的组织，在10例HS3ST2基因启动子甲基化阳性的宫颈组织中，HS3ST2基因mRNA的表达水明显低于10例启动子甲基化阴性的组织（both P<0.01）。35例宫颈癌组织中的IFITM1蛋白表达水平明显低于35例宫颈正常组织（P<0.01）。结论：IFITM1基因启动子甲基化抑制了其在宫颈癌组织中的表达, IFITM1基因是新疆维吾尔族妇女宫颈癌的抑癌基因。HS3ST2基因启动子甲基化使基因在宫颈癌组织mRNA表达水平降低。HPV16/18影响IFITM1基因和HS3ST2基因启动子甲基化。HS3ST2基因启动子甲基化可能是宫颈癌发生早期的关键分子标志，是有大规模临床试验和应用价值的早期子宫颈癌筛查的分子标志物。