加快建立生态补偿机制是党的十六届五中全会提出的一项全新战略任务，是实施全国主体功能区规划的重要政策支撑。按照全国主体功能区规划部署，设计出一套符合我国国情、远近结合、切实可行的主体功能区生态补偿机制，对组织实施好全国主体功能区规划，促进区域协调发展和国土空间高效利用具有重大的理论和实践意义。　　 论文从理论和实践的角度，比较系统地研究了主体功能区生态补偿的理论基础、总体框架、补偿标准、资金筹措、补偿途径、补偿方式、保障措施等若干重大问题，研究提出了进一步推进相关工作的具体思路和政策建议。论文在以下四方面进行了探索性研究:　　 一、是梳理和完善了我国主体功能区生态补偿的理论基础。在明确界定主体功能区生态补偿概念内涵的基础上，论文把地域差异和分工理论、区域比较优势理论、区域外部性理论、区域协调发展理论作为主体功能区生态补偿的四大理论基础，是对既有研究成果的补充和完善。特别是引入区域协调发展理论，既符合主体功能区的理念，又为明确区域生态补偿的目标等提供了理论依据。　　 二、是初步构建了我国主体功能区生态补偿的总体框架。根据主体功能区规划对我国国土空间的类型划分，论文研究提出禁止开发区域生态补偿、限制开发区域（重要生态功能区）生态补偿、限制开发区域（农产品主产区）生态补偿的总体架构，克服了现有研究成果存在的系统性不够、空间划分不清晰、实践指导性不强等问题，具有一定的理论和实践指导意义。　　 三、是提出了我国主体功能区生态补偿标准的人地双补偿思路。根据主体功能区生态补偿的内涵，论文提出实行对“地”补偿和对“人”补偿的双补偿思路。对“地”的补偿，就是要对生态服务提供区为生态保护和建设投入的全部成本进行足额补偿;对“人”的补偿，就是要对生态服务提供区的基本公共服务、人均财力、城乡居民收入差距等实行差额补偿，并提出不断提高补偿标准的动态思路。这体现了主体功能区生态补偿的内涵，具有较强的实践指导性。　　 四、是构建了我国主体功能区生态补偿考核的目标体系。论文从生态和民生改善两方面提出了定量考核生态补偿效果的指标体系和计算方法，为明确补偿方和受偿方的权力和义务，建立补受双方的激励和约束机制提供了依据，填补了国内相关研究的空白。当然，考核指标体系还处于总体设计阶段，需要在实践中不断丰富和发展。