作为第一个由中国倡导建立，并以中国城市命名的地区合作组织，上海合作组织及其前身“上海五国”机制起源于中国、俄罗斯、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦加强边境互信的安全合作，它的两大支柱是军事安全合作和区域经济合作。自1996年上述五国元首在上海首次会晤以来，在各成员国的共同努力下，组织区域经济合作的基础日厚，已经从萌芽阶段步入了务实合作的新时期，并形成了一系列相应的法律文件，但其发展水平与另一支柱军事安全合作相比较为低下，且存在着较多的问题和不足。 本文站在经济全球化和区域经济一体化浪潮交相辉映的国际经济社会环境及中国和吉尔吉斯斯坦均已加入WTO的历史背景下，综合运用引力模型、双边贸易专业化指数、显示性比较优势指数等多种数学工具和激励相容理论、新经济地理学等相关经济学理论并结合区域内外新的经济、社会数据来详尽研究在组织相关法律文件和WTO相关规定约束下的上海合作组织区域经济合作问题。具体而言，本文分析了上合组织开展区域经济合作的现状、有利条件、对成员国的影响和存在的制约因素，并在此基础上提出了各成员国政府为促进上海合作组织区域经济合作宜采取的对策和措施。 本文综合运用各种数学工具和相关经济学理论，详尽证明了两个观点：第一，尽管现阶段包括贸易、投资、能源、交通等各方面在内的上合组织区域经济合作还有许多不尽如人意之处，并且在经济、政治、文化等多方面存在着制约因素，但上海合作组织区域经济合作的前景是相当可观的；这是由于各成员国间基于要素禀赋的贸易结构互补性较强，贸易和投资发展潜力巨大，从区域内的经济合作中会得到较大的净福利，而且各国在政治、军事、安全和反恐领域的合作为区域经济合作提供了良好的政治安全保障。第二，我们也不能期望上合组织区域经济合作在短时间内自然而然地就取得很大的成果，对其要有长远的规划和艰苦的认识。在现有条件下，为加快上海合作组织区域经济合作的向前推进，各国政府必须遵循市场经济和平等互利的原则，采取各种有力措施，如加大贸易投资便利化的力度，加速机制化建设，以点带面，以双边和次区域经济合作推进多边合作等。