TDG蛋白G:U活性区域的界定及其生物信息学分析

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TDG (Thymine DNA glycosylase)最初被Josef Jiricny实验室发现时,因为其具有切除G:T错配中的T而被命名为胸腺嘧啶糖苷酶的。后来的研究发现,TDG其实是属于MUG (Mismatch-directed uracil-DNA glycosylases)蛋白家族,具有MUG蛋白一般属性,即有修复G:U错配的功能。后来越来越多的研究发现,TDG不仅仅具有碱基切除修复的功能,它还与基因表达调控、CpG岛甲基化、胚胎发育及肿瘤的发生与治疗都有密切的联系,因此它受到了学术界的广泛关注,到目前为止也取得长足的发展。本实验室近年来围绕TDG的结构与功能关系开展了系列研究。本研究中,我们侧重于TDG的G:U错配修复功能的活性结构域的研究。在研究中,我们发现mTDG (mouse TDG)维持G:U错配修复的活性结构域并不需要此前文献报道的123-374位氨基酸区域,而应该是更小的范围。因此,为了精确地界定出mTDG维持G:U错配修复所需的结构域,我们构建了一系列mTDG的N-端和C-端截短变体,然后表达纯化及G:U错配活性分析。最后通过分析在N-端和C-端中维持G:U错配修复活性所需的边界氨基酸,我们精确地定位出了mTDG维持G:U错配修复的最小活性结构域为148-279位氨基酸。此外,我们还从分子动力学模拟的角度出发对五个关键的截短变体的结构进行模拟分析,探讨了其结构与活性之间的关系,从而对我们所界定的结构域进行了分析验证。
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