【摘 要】
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该文利用大规模DNA序列测定的方法,对猪脂肪组织进行了EST序列测定和初步的分析.猪脂肪大规模EST序列共测定了10860个单向单次测定反应,所处理的总克隆数达到了8,730,421个碱
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该文利用大规模DNA序列测定的方法,对猪脂肪组织进行了EST序列测定和初步的分析.猪脂肪大规模EST序列共测定了10860个单向单次测定反应,所处理的总克隆数达到了8,730,421个碱基,成功反应数为9297(85.61﹪).使用STACK-PACK软件进行聚类分析,得到4354个基因聚类,包括3609个singlet基因和45个多拷贝基因;将侯选基因序列用于BLASTN与nr库进行比较.为了估计所测EST序列中背景序列在猪脂肪组织cDNA文库中的变异情况,将所测大于100bp的克隆与线粒体基因、人重复序列数据库、细菌基因组库、人核糖体RNA库进行了同源性比较.我们提取出了全部与MHC相关的EST序列(257个克隆).发现所有EST的部分序列(长约200bp),几乎分布在每一个己知猪BAC的所有编码序列上.MHC是一个十分重要和有用的遗传标记,其高度的多态性,和它独具的一些特性、复杂的构成,在免疫调节中的重要性等等,都为我们深入的研究MHC,全面解析它的功能,提供了一片广阔的、充满希望的前景.
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