我国已进入全面建设小康社会的新时期，但是，贫困问题仍然存在，特别是中西部贫困地区的农村，贫困尤为突出。为使贫困地区农村人口缓解和脱离贫困，国家每年都要投入大量的专项扶贫资金，支持贫困地区农村农业的发展。然而不少专项扶贫资金在使用过程中出现严重的渗漏，专项扶贫资金不专用，据统计至少有80％的扶贫资金不能到达贫困的农村和真正贫困的农户。不少研究认为，出现问题的主要原因是管理不善、监督不力，这样的认识过于笼统。本文通过新制度经济学方法分析和实地调查的案例分析相结合，发现事实上有更深层的原因，那就是，在专项扶贫项目实施过程中的真正实施主体，即基层的政府组织、政府官员、参与项目的政府一般工作人员及技术推广员、农民、企业等，他们的动机、目标、行为是不一致的，这种不一致，导致了在专项扶贫中的各个主体行为低效，从而使很多专项扶贫项目归于失败。本文的研究为提高专项扶贫的实施效果提供了理论依据，也为全面认识专项扶贫中的微观主体提供全新的视角。