本研究以西北农林科技大学园艺学院辣椒遗传育种课题组利用远缘杂交和诱变技术所选育的3个辣椒雄性不育材料3A、4A、5A及其相应的保持系3B、4B、5B为试材，基于同源序列的候选基因克隆的方法，分离并克隆到了与辣椒细胞质雄性不育相关的线粒体基因片段，利用反向PCR技术扩增其侧翼序列，并研究了雄性不育相关基因的转录表达情况。主要结果如下： 1.建立一种利用辣椒叶片提取线粒体DNA(mtDNA)的方法。该方法以辣椒幼嫩叶片为试材，采用差速离心和高盐萃取相结合的方法，分离叶片线粒体。然后利用SDS和蛋白酶K裂解线粒体，提取线粒体基因组。该方法无需培养黄化苗，试材供应充足，对试剂及仪器的要求低，一般实验室均可满足。该法分离提取的线粒体DNA经电泳和分光光度法测定，能满足分子生物学后续研究的要求。 2.基于同源序列的候选基因克隆的方法，以3个辣椒雄性不育材料线粒体基因组为模板，均扩增得到一条线粒体差异片段cms330。经克隆测序及序列分析表明，该片段与己报道的辣椒雄性不育相关基因orf456高度同源，核酸序列同源性高达99％，推测的蛋白质序列完全一致，表明3个辣椒雄性不育材料的不育分子机理可能与报道的辣椒分子机理相似。 3.利用反向PCR技术，扩增已知片段cms330的侧翼序列，得到一长约3kb的差异片段。经克隆测序及序列分析表明，cms330的上下游部分序列均与编码烟草NADH脱氢酶基因有80％以上的同源性，表明极有可能是cms330片段与线粒体NADH脱氢酶基因发生了重组。 4.提取3个辣椒不育材料和相应保持系叶片和花蕾的总RNA，研究了cms330的转录情况。结果显示，辣椒雄性不育相关基因片段cms330在3个辣椒不育材料中均表达，并且在叶片和花蕾中均会表达。