利用单细胞转录组测序研究发育中脑干的细胞多样性

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目的:探索人类胚胎期脑干组织(Human embryonic brain stem tissue,HEBST)的细胞多样性及其发育情况,为进一步研究人类脑干组织提供新的标记基因,同时给临床上产前监测技术提供新的理论依据。方法:1、收集临床上胚胎期9周至12周的人类胚胎脑干组织。2、利用单细胞转录组测序技术探索9周到12周人胚胎脑干组织基因表达差异性。3、采用生物信息学方法对收集到的数据进行初期质控和筛选。4、将筛选后的样本数据通过Seurat平台进行整合分析。5、利用Monocle3平台探索人胚胎脑干组织的发育情况。6、利用org.Hs.eg.db数据库中的相关数据与本实验中的数据进行对比,同时利用KEGG和GO分析方法研究本实验数据中的细胞功能方面的信息,与此同时进一步验证本实验数据的真实性。7、利用GSEA方法进一步研究人类脑干组织的差异基因富集通路。结果:1、人类胚胎脑干组织(HEBST)中细胞多样性概述。2、在HEBST发育过程中,不同类型的GABA细胞具有细胞间异质性。3、感觉神经也参与整个脑干的发育过程。4、脑干细胞中感觉神经元的功能验证。5、浦肯野细胞存在于人类胚胎时期。6、各种胶质细胞类型参与了HEBST发育过程。7、脑干组织在脑干神经系统中的疾病通路研究。结论:人胚胎脑干组织有新定义的细胞多样性。各个胚胎脑干细胞类型在发育过程中表达不同的标记基因。浦肯野细胞参与着胚胎期神经系统的发育。研究神经系统中的疾病通路相关性对于临床上产前护理和产前监测具有积极的意义。
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