我国柑橘属劳动密集型产业，生产管理经营粗放，随着用工和农资价格持续攀涨，自然灾害、虫灾疫病等农业突发事件的接踵而至，使得我国种植业农产品柑橘的投入产出效率极为低下。我国柑橘在水果产业中占有重要地位，但缺乏柑橘产业生产投入产出关系及其资源配置问题的深入研究，尤其缺乏经济学意义上的剖析。一些农业经济学者从柑橘的生产现状展开了讨论，但鲜有经济学家涉及柑橘投入产出效率这一经济研究领域。基于此，笔者选取我国柑橘主产省（区、市）生产成本与收益的样本数据，采用DEA方法着重对柑橘投入产出效率进行各个省份间的横向比较、不同年份的纵向比较，比较不同品种柑橘的投入产出效率差异，探讨柑橘生产中如何节本增效，合理投入、提高产出效率，为南方柑橘主产省份的果农提供科学的政策导向。首先，在界定了柑橘主产省份和柑橘品种后，从生产规模和产出视角对我国柑橘生产在水果中的地位做了简要阐述，接下来，对我国柑橘投入产出要素构成及生产成本变动趋势进行详细分析。基于我国柑橘投入与产出现状的讨论，选取柑橘类水果的两大品种柑和橘，根据要素比重确定了要素投入指标和产出指标，为下文实证分析奠定基础。其次，采用DEA-Malmquist生产率指数方法，通过纵向时间序列与横向柑橘主产区的分析，动态探究分品种、分省份的柑橘全要素投入产出效率，剖析其变化趋势特点及引起这些变化的原因，寻找TFP增长的根源及提高我国柑橘投入产出效率的有效途径。结果发现，样本年间我国柑橘TFP波动较大，TFP变动对柑品种、橘品种增长的贡献度分别为10.8%、16.3%，技术效率变动波动较小，柑橘前沿技术进步是促进TFP增长的主要驱动力。第三，从静态微观角度，对各个柑橘主产省（区、市）的投入产出效率进行横向测算和实证研究，分析了非有效决策单元效率损失的原因并对其投入要素数量进行调整，最后就无效率省（区、市）柑橘投入产出效率低下的原因及调整方案进行着重探讨并给出进一步的资源配置优化方案。研究表明，农药投入和其他物质费用投入冗余高达31.2%和37.1%，肥料、劳动力均出现不同程度的冗余，不同省份间柑橘投入产出效率差异较大。第四，采用Tobit模型对影响我国柑橘投入产出效率的影响因素展开分析，计量回归结果显示，我国柑橘产业已初具规模，不能再通过扩大适生区的种植面积来提高投入产出效率；农药和肥料投入是制约柑橘投入产出效率低下最重要的因素；劳动密集型的柑橘产业特征决定了柑橘投入产出效率并不很高；自然灾害的发生降低了柑橘投入产出效率，而农资的正向影响有利于提高柑橘的投入产出效率。最后，基于以上讨论与实证分析结果，提出如下政策建议：充分发挥柑橘产区的规模效益优势，加快集约化柑橘生产；合理调整各生产要素的投入比例，不断提高柑橘投入产出效率；动态监控病虫害，加大检疫性病虫害防治力度；充分发挥科技资源优势，通过提高柑橘前沿种植技术进步水平来改善柑橘投入产出效率；果业局等相关部门有必要采取更为有效的举措抑制农资价格的大幅上涨，提升果农增收空间。笔者认为，该研究仍需进一步延伸探讨：柑橘主产区贴近农户第一手数据资料的调研工作的展开；农业科技对柑橘产业增产增收的贡献要依具体省份和推广时机而定，尚不能一概而论；不应局限于果农视角柑橘投入产出效率的探究，对主产区柑橘合作社、附加值最大的柑橘加工流通与市场营销环节、柑橘信息服务等领域也要有所触及。