骨肉瘤相关差异基因的筛选及TRIP13的生物学功能分析

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背景:骨肉瘤(Osteosarcoma,OS)是最常见的恶性骨肿瘤,其发生发展的生物学机制仍然不清楚。本研究旨在利用生物信息学的方法寻找骨肉瘤早期诊断和治疗的靶点并进行实验验证。方法:首先,利用生物信息学的方法筛选骨肉瘤相关的差异基因,并对这些差异基因进行生物学功能和KEGG通路富集分析。通过大量查阅文献从差异基因中挑选出一个与骨肉瘤发生发展相关的基因——TRIP13。其次,利用WB和PCR验证TRIP13在骨肉瘤组织和U2OS细胞中的表达水平。最后,CCK8,WB,划痕实验,Hochest33258染色探索TRIP13敲除对U2OS细胞的增殖,迁移,侵袭和凋亡的作用及其机制。结果:从数据集中共获取211个差异基因,这些基因主要与细胞周期,染色体分离和细胞黏附等有关。前十位关键基因包括:CCNA2,CCNB1,AURKA,TRIP13,RFC4,DLGAP5,NDC80,CDC20,CDK1,KIF20A。TRIP13的表达水平在U2OS细胞和骨肉瘤组织中升高。在U2OS细胞中,TRIP13的敲除能抑制增殖,迁移,侵袭和促进凋亡。机制方面,与空白组和阴性对照组相比,TRIP13敲除组的U2OS细胞中p-PI3K/PI3K和p-AKT/AKT的值显著降低。PI3K/AKT抑制剂处理TRIP13敲除的U2OS细胞后,增殖、迁移和侵袭能力显著降低,凋亡能力显著升高。结论:TRIP13的敲除通过抑制PI3K/AKT信号通路抑制U2OS细胞增殖,迁移,侵袭和促进凋亡。TRIP13可能成为OS诊断和治疗的潜在靶点。
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