利用DDI2启动子开关调控酿酒酵母中基因的表达

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基因表达是以染色体DNA序列为模板合成功能性基因产物的过程。调控基因表达对生物体正常生长和响应环境变化至关重要。基因表达调控涉及许多因素,其中启动子是重要的调节因子常被用于实验室研究和工业发酵中。在酿酒酵母中,各种强度的组成型和诱导型启动子提供了一个宽阔的遗传调控范围。  DDI2启动子(PDDI2)是在研究酿酒酵母DNA损伤应答过程中所发现的,该启动子能在氰胺诱导下高效表达。且相对于其它常用的诱导型启动子,PDDI2整体培养时间和成本较低。为了进一步帮助酿酒酵母基因的表达调控,我们提出了一种基于DDI2启动子(PDDI2)的新型基因“开关“方法,可用于原位调控基因表达。这种方法首先需要构建一个可重复利用的盒式表达载体(PDDI2-URA3-PDDI2)并将其整合到酵母目的基因的上游,通过一步整合与两步筛选后,PDD2无痕取代了其天然启动子。之后利用诱导剂氰胺便可以打开/关闭目的基因的表达。实验结果表明,PDDI2作为基因“开关”能线性调节目的基因的表达水平。本研究利用PDDI2替换了酵母基因RAD18,TUP1和CDC6的启动子进行了概念验证。  除了作为基因“开关“,DDI2能够被氰胺高效诱导的优点也使其成为一种良好的蛋白表达工具。在研究蛋白质与DNA相互作用的单分子实验中,需要给蛋白标记合适的荧光探针。目前有多种分子可以作为探针,例如GFP、有机染料、量子点等。与其他荧光探针相比,量子点(Qdots)高的光稳定性和光亮度使其在单分子研究中有着明显的优势。这些优点让量子点在单分子实验中可实现长时间的观察(数分钟至数小时)和高质量图像采集。为了实现位点特异性的量子点标记,我们需要对目的蛋白进行生物素修饰。我们建立了简单的体内生物素修饰目的蛋白的方法,并用PDDDI2表达纯化了高效生物素修饰的Avi标签融合的蛋白。我们选择Sld2作为目的蛋白对该方法进行了验证。在酵母中给Sld2添加了Avi融合标签,并同样用PDDI2过表达BirA酶进行体内生物素修饰。最后通过免疫印迹实验证明了我们方法的可行性。
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