基于4-羟基-2,6-二氟-1,3,5-苯三腈/半胱氨酸偶联反应构建噬菌体展示环肽库

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在诸多生理过程中,蛋白质通过发生高度特异性的蛋白-蛋白相互作用发挥着重要功能。因此,以蛋白-蛋白相互作用界面作为药物设计的靶点,成为近年来具有潜力的研究方向。多肽是一种分子量介于有机小分子与生物大分子间的生物低聚物。与小分子相比,它与靶标特异性结合的亲和力高;与生物大分子相比,它成本低廉,穿透性好,免疫原性低。然而,线性多肽构象多变,易被蛋白酶水解,使得多肽药物的发展极大受限。为解决线性肽构象多变和稳定性差的问题,科学家们通过骨架修饰和环化的方法构建构象受限的多肽。环化不仅能够保持多肽的天然活性,提升酶解稳定性,还可减小线性多肽的构象自由度,降低结合自由能,利于与靶标结合。在天然环肽中,独特的刚性小环能够进一步限制多肽的构象。因此,向线性多肽中引入刚性苯环分子进行芳基化修饰,构造稳定碳硫键辅助的刚性环肽骨架成为环肽方法学中较为重要的方法。为了探索蛋白-蛋白相互作用界面有序的空间结构与结合表位的耐受序列,科学家们发展了结构不同的噬菌体环肽库。通过对不同靶标蛋白进行筛选,我们可以快速可靠地得到相互作用界面的功能信息,并以此作为药物设计的起点,进一步发展具有高亲和结合性的环肽配体。本论文共分为三章,主要包括以下内容:第一章:首先综述了蛋白-蛋白相互作用的作用机理以及多肽药物发展的挑战与机遇,阐明了发展多肽环化方法学的必要性。其次,分类介绍当前常见的多肽环化方法,概述当前的研究现状和主要问题。最后,基于该领域的发展需要与研究现状,提出本论文的研究思路,简述主要研究内容以及意义。第二章:探 索 4-羟 基-2,6-二 氟-1,3,5-苯 三 腈(2,4-difluoro-6-hydroxybenzene-1,3,5-tricarbonitrile,DFB)在生物相容的温和条件下与含有半胱氨酸的多肽的反应活性、序列耐受性、生物相容性、产物稳定性等性质,构建无需催化剂、无需有机溶剂,高效温和,符合绿色化学理念的一元环肽方法。第三章:基于DFB与半胱氨酸的偶联反应,我们将DFB用于含有双半胱氨酸的噬菌体库翻译后修饰中。用DFB分子构建新型噬菌体环肽库(骨架序列:CX9C),针对不同的靶标蛋白进行筛选,挑取实验组单克隆菌落进行DNA测序后得到具有保守序列的多肽,并利用荧光偏振实验考察筛选序列的活性。最后,针对本文中研究内容进行了总结和展望。
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