柳枝稷TCP转录因子家族全基因组鉴定和分析

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研究植物的抗盐机理是一种对盐渍土生物改良的热门方式,本文研究的TCP转录因子在高等植物中具有独特的功能,它能够在植物整个生长发育阶段中起到重要的调控,如植物生长、发育和应激反应等等。然而,柳枝稷(Panicum virgatum L.)中尚未宣布TCP基因家族的全基因组分析及其在盐胁迫中的作用。本文将从两个方面进行研究,一方面从柳枝稷的基因组中鉴定出42个PvTCP,其中38个成员可以不均匀地锚定在其染色体上,也预测到9个PvTCP是microRNA319(miR319)靶向基因。此外,根据系统发育关系和保守结构域分析显示,它们可以分为三个进化枝。同一进化枝中的成员具有相似的基因结构和基序定位。尽管所有PvTCP都能够在我们分析到的不同组织中表达,但它们的表达谱在正常条件下是不同的,这可能暗示了它们在植物生长和发育中的不同作用。此外,在PvTCPs的启动子区域中检测到约20个顺式作用元件,40%与盐胁迫下应激反应有关。同时,还分析了盐胁迫下PvTCPs的表达谱,发现有29个PvTCPs对盐胁迫有响应。另一方面,TCP转录因子在转录后水平还受到miR319的调控,于是,我们构建了miR319超表达载体,成功获得了阳性植株,以供后期分析。总之,本文分别从基因组水平和转录后水平上对PvTCP基因家族进行了分析,初步探索其在盐胁迫中的可能功能,为进一步对柳枝稷中PvTCPs的功能分析奠定了基础。
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