SELDI-TOF-MS技术在肺癌化疗个体敏感性中的研究

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目的:SELDI-TOF-MS技术在晚期肺癌化疗敏感性相关蛋白质因子的研究。方法:选取浙江大学附属第二医院化疗科2005年4月~2008年11月化疗初治晚期肺癌病例28例,在化疗开始前及两疗程化疗结束后分别收集患者血清标本,采用CM10芯片(阳离子交换蛋白芯片)为检测介质,经表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)测定,检测蛋白质质谱,并运用浙江大学蛋白质谱数据分析系统软件(ZJU-PDAS)分析比较,应用支持向量机进行训练和交叉验证,结合生物信息学方法,筛选出各化疗方案所达CR、PR、SD、PD的患者血清中蛋白表达的肽链指纹图谱,寻找与各类型肺癌患者化疗敏感相关的差异蛋白峰,确定一种或一组蛋白标志物。联合这些标志物用人工神经网络或支持向量机训练并建立肺癌血清蛋白质指纹图谱化疗敏感相关模型,并做交叉验证评估其诊断的灵敏度和特异度。结果:1.通过非小细胞肺癌组与小细胞肺癌组比较,得到12个差异蛋白峰,并以此建立诊断预测模型,其敏感性100%,特异性100%,验证结果敏感性为94.28%,特异性80%。2.通过化疗敏感组与化疗抗拒组比较,得到7个差异蛋白峰,并以此建立诊断预测模型,其敏感性为92.31%,特异性为100%。验证结果敏感性为76.92%,特异性为87.50%。3.通过预后好组与预后不好组比较,得到4个差异蛋白峰,并以此建立诊断预测预后模型,其敏感性为100%,特异性为100%。验证结果敏感性为85.71%,特异性为83.87%。4.m/z(质量/电荷,质荷比)为4969的蛋白质峰在小细胞肺癌组中明显表达高于非小细胞肺癌组,在化疗敏感组中表达明显高于化疗抗拒组,提示m/z为4969的蛋白质峰与小细胞肺癌及化疗敏感相关;m/z为4140的蛋白质峰在化疗抗拒组中表达明显高于化疗敏感组,在预后不好组中表达高于预后好组,提示m/z为4140的蛋白质峰与化疗抗拒及预后不好相关;m/z为5482的蛋白质峰在化疗敏感组中表达明显高于化疗抗拒组,在预后好组中表达高于预后不好组,提示m/z为5482的蛋白质峰与化疗敏感及预后好相关。结论:1.运用SELDI-TOF-MS技术所建立的肺癌血清蛋白质化疗敏感性指纹图谱模型在预测肺癌分型、化疗敏感性、预后中具有非常高的敏感性与特异性,可望成为很好的预测工具。2.通过进一步的分离和鉴定,m/z=4969的的蛋白质峰很可能为预测小细胞肺癌及化疗敏感的肿瘤标志物,m/z=4140的蛋白质峰可能为预测化疗抗拒及预后不好的肿瘤标志物,m/z为5482的蛋白质峰可能为预测化疗敏感及预后好的肿瘤标志物,使进一步开发临床诊断试剂盒成为可能。3.预测肺癌分型血清蛋白指纹模型对于临床上只获取细胞学依据而无法进行病理分型的患者,在治疗上具有较强的指导意义;预测肺癌化疗敏感性血清蛋白指纹模型在化疗受益人群评估具有重要的临床意义,为探索肺癌个体化治疗提供新思路,有可能为以后术前新辅助化疗治疗提供平台。
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