【摘 要】
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目的淋巴结转移是预测和判断结直肠癌患者预后的关键因素。90%以上的结直肠癌相关死亡率与结直肠癌远处转移有关。MicroRNAs（miRNAs）和mRNAs在调节肿瘤转移中起着重要作用,有望成为大肠癌诊断的生物标志物。本研究旨在建立一个基于miRNA和mRNA的淋巴结转移预测模型,以提高预测的准确性。方法从基因表达综合数据库（GEO）下载编号为GSE56350、GSE70574和GSE95109的数
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目的淋巴结转移是预测和判断结直肠癌患者预后的关键因素。90%以上的结直肠癌相关死亡率与结直肠癌远处转移有关。MicroRNAs（miRNAs）和mRNAs在调节肿瘤转移中起着重要作用,有望成为大肠癌诊断的生物标志物。本研究旨在建立一个基于miRNA和mRNA的淋巴结转移预测模型,以提高预测的准确性。方法从基因表达综合数据库（GEO）下载编号为GSE56350、GSE70574和GSE95109的数据集芯片,同时从癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载569个结直肠癌统计数据。使用R软件进行差异基因分析,得到差异表达的miRNA和mRNA。然后,使用FunRich数据库进行了目的基因的功能富集分析和信号通路富集分析。随后,在预测miRNA靶向mRNA的基础上,利用Cytoscape软件构建mRNA-miRNA网络。最后,我们采用qRT-PCR（实时荧光定量PCR）和GEO数据集验证了基因表达水平。结果通过数据分析,总共筛选出5个差异表达的miRNAs和34个mRNAs。此外,鉴定出2个关键miRNAs和1个基因,其中包括hsa-miR-99a、hsa-miR-100和硫酸肝素-葡萄糖胺3-磺基转移酶2（HS3ST2）。GEO数据集和qPCR的结果表明,关键miRNA和基因的表达与生物信息学结果一致。经过差异表达分析、预后预测和实验验证,在结直肠癌淋巴结转移中发现了一个新的miRNA-mRNA调控网络:hsa-miR-99a-HS3ST2-hsa-miR-100。结论综上所述,通过系统的生物信息学分析和实验验证,我们发现了结直肠癌淋巴结转移中潜在的miRNAs及其靶基因,建立了一个新的miRNA-mRNA调控网络,可能作为结直肠癌淋巴结转移的潜在生物标志物。
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