自体动静脉内瘘流出道静脉狭窄组织环状RNA的差异表达

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:loakl
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目的:通过RNA测序对尿毒症患者自体动静脉内瘘(autologous arteriovenous fistula,AVF)血管狭窄组织中环状RNA(circular RNA,circ RNA)进行测序,并检验环状RNA表达谱的差异变化,探讨circ RNA与AVF血管狭窄发生进程可能存在的关系。方法:选择标准对照组4例:从2017年2月-5月本科室确诊收治的54例需行动静脉内瘘成形术尿毒症患者中随机选取4例排除明显血管狭窄和血管疾病的患者;实验对照组4例:从同期本科室确诊收治的54例尿毒症患者中随机选取4例确诊为AVF狭窄的患者。AVF狭窄确诊:标准动静脉内瘘AVF使用寿命3月以上,血液透析时AVF血流量<200ml/min;狭窄的程度大于50%,上肢血管超声等影像学结果排除血栓。然后抽提实验组和对照组总RNA样品,分别检测其circ RNA表达谱的差异,随后筛选出差异表达的circ RNA(p<0.05,差异表达≥2倍),进行聚类分析,基因功能分析、KEGGpathway等分析;并用实时荧光定量PCR(real-time RT-PCR,q RT-PCR)对RNA测序结果进行验证;结果:从RNA测序检测的17620份circ RNA转录本中鉴定出208份circ RNA在实验组和对照组中有显著差异表达(P<0.05,差异倍数≥2倍),其中92份实验组相比于对照组表达上调,116份表达下调。circ RNA表达差异分析表明实验组和对照组的circ RNA表达确实存在明显差异,KEGG分析提示注释到Focal adhesion signaling pathway是最多的,其显著性最高亦是Focal adhesion signaling pathway。随后选择了8个环状RNA经q RT-PCR验证,其中只有hsacirc_015036与测序结果一致。结论:尿毒症患者自体动静脉内瘘血管狭窄组织与非狭窄组织确实存在circ RNA差异表达,其中hsacirc_015036和Focal adhesion信号通路可能在尿毒症患者AVF流出道静脉狭窄发生和发展进程中发挥重要作用。
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